自动启停发生故障还是可以继续开的。发动机自动启停系统是指在短暂停车时，根据驾驶操作及系统需求控制发动机怠速起动和停止的系统。发动机自动启停系统发生故障并不影响车辆动力性、舒适性、燃油经济性以及制动系统的性能。
发动机启停就是车辆的功能配置，自动启停失效要不要修主要取决于车主还想不想要这个功能。不过，由于发动机启停系统可能会影响到其他功能配置的使用。每款车型的配置安排各有特点，除了根据自身需求，应当结合品牌授权经销商的建议进行抉择。建议，如果发动机启停系统的失效会导致其他功能无法正常工作，有必要修复正常。
以下是一些有关发动机启停系统的常识分享：
1、发动机启停系统停止发动机时，请勿离开车辆。由于发动机自动启动功能，可能会导致发生意外事故。
2、车辆放置在通风不良的场所时，请勿使用发动机启停系统停止发动机。由于发动机自动启动功能，发动机可能会重新起动，导致废气聚集并进入车内，从而可能严重危害身体健康甚至导致死亡。
3、在发动机停机状态下，若系统检测到相关条件不满足，即使驾驶员不触发制动踏板，发动机也有可能自动启动。