泰山区交通运输局为了更好地履行职责，设立了六个核心职能科室，以支撑日常运营和管理。首先，办公室负责统筹全局，包括机关的日常协调、文书处理、会议安排、信息传递、督办事项、保密、机要、档案管理、信访、调研、政务公开、接待等任务，以及综合性文件的起草，以及人大代表建议和政协提案的办理。此外，他们还负责机关后勤和信息化建设的管理工作。
其次，政工科主要负责局机关和直属单位的党群、人事、劳动、工资、机构编制等事务，指导交通运输行业的人员队伍建设，执行行业职业资格制度，管理机关和直属单位的离退休人员，以及行业教育和培训的指导工作。
财务科则是关键部门，负责交通行业的财务审计、投融资、行政事业性收费管理，编制和监管财政预算，包括交通专项资金、预决算、政府采购、外汇和信贷工作，以及国有资产的监管。他们还指导局机关和直属单位的财务和资产管理。
对于规划与基础设施建设，规划基建科负责制定全区综合运输体系规划，拟定和执行行业规划、计划，参与物流业发展策略，分析行业经济运行，优化行业结构，负责公路建设市场监管，以及公路工程的设计、施工和质量监督。
安全监管是不可忽视的职责，安全监督科制定行业安全生产规章制度，指导安全生产体系和应急响应，监管公路运输企业的安全，组织事故调查，指导建设和维护工程的安全生产，并推动节能减排工作。
最后，政策法规科承担重要责任，起草交通运输法规草案，拟定政策，审核文件合法性和行政执法工作，管理超限超载检测站，监督交通执法队伍，处理行政复议和诉讼事务，以及参与交通综合治理和治理公路“三乱”工作，指导行业体制改革。