第一，分镜头，没有必要用软件制作，如果一定需要，toonz足够了。
第二，原画，动画制作原画是没有软件可以代替的，必须由手工完成，这也就是为什么传统二维动画工期长的原因。
第三，扫描，上色的软件很多，animation是比较常见的一种，但是使用起来比较繁琐，而且已经是很多年前的软件了，没有矢量处理功能，去套色线还有上色等能力都属于中下等。日本的retas系列中的traceman是我目前见过的最好的动画扫描软件，功能强大，而且操作简单，但是似乎很难搞到中文版本，更别说盗版的了，至于正版软件的价格,retas HD系列的全套价格是52万日元左右。
第四，合成，国内公司大多使用的都是ae和combustion,功能不可谓不强，但是由于太过全面，不是动画专业的，所以使用起来有一定困难，但可发挥余地很大。reats系列中的coreretas虽然性能没有那么强，但是专业对应动画合成，当然了，动画制作报价就很高。
至于流氓兔什么的软件，都是flash做的。那不属于二维动画。ANIMO\TOONZ\RETAS\USANIMATION这些软件都是一类型的软件，是用在中期制作的。中期上色和编辑动画用的，一般很多动画工作室很多用ANIMO主要用于商业动画。flash一般都是制作矢量动画用的，为了让画面失真，制作高品质的动画，都是用Flash软件。
二维动画：Flash、Photoshop
Flash是现在国内主流的二维动画制作软件，很好用也很简单；photoshop主要作为辅助的作图软件处理动画中需要的图片。
三维动画：3DMAX Maya
3DMAX在国内主要用于建筑动画的制作；Maya主要用于角色动画制作。同时还需要一些配音和视频线性编辑的软件作为辅助。制作动画需要系统的学习，掌握软件并不能完成动画片的制作。如果是做gif小动画的话ps里的功能就能完成。
Flash
Flash是一款优秀的网页动画设计软件。它是一种交互式动画设计工具，用它可以将音乐，声效，动画以及富有新意的界面融合在一起，以制作出高品质的网页动态效果。
为什么用flash？
大家知道，HTML语言的功能十分有限，无法达到人们的预期设计，以实现令人耳目一新的动态效果，在这种情况下，各种脚本语言应运而生，使得网页设计更加多样化。然而，程序设计总是不能很好地普及，因为它要求一定的编程能力，而人们更需要一种既简单直观又功能强大的动画设计工具，而Flash的出现正好满足了这种需求。
flash的特点:
使用矢量图形和流式播放技术;
通过使用关键帧和图符使得所生成的动画(、swf)文件非常小;
把音乐，动画，声效，交互方式融合在一起，凌智动画可以创作出了许多令人叹为观止的动画(电影)效果;
强大的动画编辑功能设计出高品质的动画，另外，与网页设计工具Dreamweaver配合默契，可以直接嵌入网页的任一位置，非常方便。
Photoshop
Photoshop是平面图像处理业界霸主Adobe公司推出的跨越PC和MAC两界首屈一指的大型图像处理软件、 Photoshop支持众多的图像格式,对图像的常见操作和变换做到了非常精细的程度。它拥有异常丰富的插件(在Photoshop中叫滤镜),熟练后您自然能体会到"只有想不到,没有做不到"的境界、
3DMAX简介
全称是 3－Dimension Studio，译成中文应该是“三维影像制作室”。 用MAX来制作三维动画就像是当一个大导演——一切的角色、道具、灯光、摄像机、场景（包括如云、雾、雪、闪电等特效场面）及配音、镜头的剪辑合成等等都任你来安排处理。而用MAX修改创建的模型更是轻而易举的事，完全可以把宝贵的时间和精力集中用在使设计更加完美更加理想上。
MAX适应的领域：电影特技、立体和影视动画广告设计、工业设计、建筑和室内装潢设计、包装与装潢设计、三维游戏开发等。
专业动画制作软件
试试看Toon Boom Animate Pro适合独立动画人使用。我记得有人提供下载的，是动画软件，不过不是最好的，好的都要花钱买的，所以好的软件都是动画公司在用的
单纯的后期就是Premiere和After Effect简称称AE，可以合3d背景
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