五大忍国割据的这片大陆，云、岩、雾、砂四国村落的血继限界忍者突然之间相继失踪，四国纷纷把矛头指向了唯一没有受到损害的火之国。
为了避免战争的发生，火之国大名向第五代火影纲手下达了“即使牺牲再大，也要找到守卫村落的途径”指令。
当天，卡卡西去医院看望受伤的鸣人和佐井，并让鸣人修复已经坏了的铃铛（详细请见火影忍者第一部的第3到5集），送给了佐井一本“解读女人心”的书。而此时此刻，旗木卡卡西以前被人布下傀儡之术也发动了，要求纲手在他身上下定时之术后，只身离开了木叶村，为的是牺牲自己，去拯救这个世界。
这天晚上，卑留呼给卡卡西下的傀儡之术发动了，目的是借助“鬼芽罗之术”让卑留呼自己变得更强。
于是，卡卡西受卑留呼的控制，离开了木叶村，前去卑留呼的基地。此时的鸣人和佐井已出院，当鸣人看到卡卡西往村外走去时，便一边追，一边喊。突然，鹿丸使用影子模仿术阻止鸣人前去，并告诉鸣人卡卡西让他转告鸣人的话。但鸣人还是随同小樱一起追卡卡西去了。于是鹿丸便召集其他的木叶9忍前去阻止鸣人和小樱。而纲手也请来了我爱罗帮忙。一路上，卑留呼相继派出自己的手下，企图阻止鸣人木叶12忍，但木叶12忍都打败了他们。后鸣人也打败了前来阻止的我爱罗，顺利到达卑留呼的巢穴。
卡卡西也已经到达这里，鸣人看到了卡卡西老师，问小樱为什么不阻止卡卡西老师，小樱回答说她叫了，但卡卡西老师听不见。当天时（金环日蚀）地利人和全部具有时，卑留呼发动鬼芽罗之术，和卡卡西一起融合成为不死的完全忍者。此时，定时之术发动了，卡卡西使出了自创万花筒写轮眼的招式：神威，企图和卑留呼同归于尽。鸣人使出多重影分身和螺旋丸，打开了卑留呼的身体，强行将卡卡西拉了出来。而卡卡西此时也因为这没有死。最后大家都继承了火意志，打败了卑留呼。
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