截止2019年8月，福建省莆田市秀屿区下辖十个镇。
分别为：
一、笏石镇
地处莆田市东南部，秀屿区西北部，是秀屿区人民政府所在地。 位于北纬25°19~4.31，东经119°05~9.10。南距国家旅游度假区湄洲岛24公里，西南距秀屿港17公里，北距莆田市区、涵江区分别为17.2公里。
二、东庄镇
位于区境西部，湄洲湾畔。该镇地处礼泉半岛，濒海多丘陵，地势东西高中间低，东西横长13.8公里，南北最狭处只1.75公里，最宽处6.38公里。
三、东峤镇
位于福建省莆田市秀屿区南部，地处兴化湾南岸、平海湾半腰部，东与平海、埭头相连，西邻笏石镇，北与北高镇相接，笏埭公路贯穿全境，距区政府8公里。
四、埭头镇
位于兴化湾南岸，三面临海，南靠平海湾，秀屿区东部，海岸线长约25公里。 其南边 为莆田乌丘屿 （乌丘乡），包括乌丘大屿（大乌丘）和乌丘小屿（小乌丘）两个岛屿。
五、平海镇
位于福建省莆田市秀屿区，在兴化湾之南、埭头与忠门两半岛之间，北起石城，南至文甲。镇东南有莆田乌丘屿上屿和乌丘屿下屿。平海湾处于兴化湾与湄洲湾之间，是莆田三湾之一。
六、南日镇
是福建省第三大岛，位于兴化湾和平海湾交汇处，距台湾新竹港72.89海里、莆田乌丘屿10.64海里。
七、忠门镇
位于东经119°04’，北经25°11’。境内大陆伸人海中，东濒平海湾，西临湄洲湾，南隔海与湄洲岛相望，东北与东峤镇接近，北边与笏石镇交界，西北与秀屿镇相连。境内最窄处的颈部，东西距离只有1.5公里，腹部则宽达14公里。陆域面积88平方公里。自西至东海岸线87公里，有石岛、烁屿、青屿、盘屿、门峡、大屿、小屿、鸭屿、铁丁仔屿、石榴屿、黄屿、黄牛屿、小礁、白礁、乌礁、外礁等16个岛屿环绕拱卫。
八、东埔镇
位于湄洲湾“黄金海岸线”上，镇西、正北、正南、东南为湄洲湾， 镇东北和东边部分为湄洲湾。
九、山亭镇
位于东经119°06′00″～119°08′56″，北纬25°07′30″～25°09′46″之间。地处秀屿区东南部，东濒平海湾与平海镇隔海相望，南与湄洲镇隔海相望、西与东埔镇接壤，北与忠门镇毗邻。人民政府驻地距秀屿城区22千米，距莆田市区42千米。
十、湄洲镇
位于莆田市秀屿区南部湄洲湾水域 ，包括湄洲岛及其旁边及其附属岛屿，湄洲岛的正式区划是 莆田市秀屿区 湄洲镇。东距台湾台中港72海里，南达厦门港 100海里，北抵福州马尾港70海里。
参考资料来源：百度百科-秀屿区