最好更正申报一下，以防万一。
根据工会经费管理规定，企业按工资总额2%计提的工会经费，40%上交总工会，60%直接留企业工会使用。如果企业因为计算错误或者操作错误导致错交了工会经费的，可以向主管部门说明，提交申请，重新填表申报，将多缴纳的部分留底以后需要交纳的部分，或者退还给企业，少缴的部分进行补缴。
工会经费(建会筹备金)工作流程
1、在电脑浏览器窗口输入"电子税务局",找到搜索结果.
2、点击"电子税务局",进入登录界面.纳税人根据单位实际情况,选择"普通登录/CA?登录/自然人/短信登录".默认"普通登录",输入"注册用户名/税号/社会信用代码",点击"登录".
3、纳税人电子税务局主界面."关于年度工会经费(建会筹备金)征收工作通知"已置于"通知公告"栏.
4、点击左上角"税费申报"后,在左侧边栏选择"通用申报-通用申报".
5、"通用申报表"的填写:①根据单位实际选择"工会经费/工会筹备金"(在□中打√)②填写"应税项",其他选项自动生成,不需要填写."应税项"为纳税单位应缴纳的工会经费(建会筹备金).③填写完毕后点击左上角"申报".④"确定申报".
6、申报成功,进行网上扣款."是否调用网上扣款"选择"是".
7、网上扣款.纳税单位根据情况选择"三方协议缴税"、"银联快捷缴税"、"银联二维码缴税""微信二维码缴税".
8、扣款成功后,可以查询和打印.
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