军统局是国民党最重要的特务机构之一，其前身是成立于南京的复兴社特务处，1938年4 月，蒋介石将中华复兴社特务处扩编为军事委员会调查统计局， 简称军统局，局长由军事委员会委员长侍从室主任贺耀祖兼任，原复兴社特务处处长戴笠以副局长职务主持工作。
抗日战争时期是军统局的全盛时代，期间军统局曾多次刺杀日伪军政人员，如暗杀张啸林、汪精卫等，对打击日军和汉奸起了不小的震慑作用。1946年3 月17日，戴笠从北平乘机返回上海途中飞机发生故障，在南京附近坠机身死。
戴笠死后不久，军统局核心单位和人员缩编为国防部保密局，由军统局主任秘书毛人凤担任局长（1948年前由郑介民代理局长，毛人凤以副局长身份主持工作），继承了原军统局的衣钵。其他人员和一些公开单位合并到国防部第二厅和内政部警察总署，这两家单位分别由原军统局帮办郑介民和唐纵担任厅长和署长。
国防部次长、第二厅厅长郑介民
内政部次长、警察总署署长 唐纵
戴笠死后军统局之所以缩编、改组，主要有以下原因：
一、规模庞大，无力维持。
抗战结束时，军统已发展成为一个规模庞大机构健全的特务组织，除内部机构有八处、十室和一个设计委员会外，还下辖中英特种技术合作所、中苏特种技术合作所、中美特种技术合作所、军事委员会水陆交通统一检查处、军事委员会航空邮电检查处、军事委员会委员长侍从室第六组、军事委员会委员长侍从室特别警卫组、军令部第二厅、内政部警务司、财政部缉私署、财政部战时货物运输管理局、财政部直接税务局、外交部护照科、陆军总司令部调查室、航空委员会政治部调查室、兵工总署警卫稽查处、重庆卫戍总司令部稽查处等十几处公开机关和忠义救国军、别动军两支武装部队，另外军统局在全国各地设置了几十家办事机构。此时，军统仅内外勤特务（不包括武装特务部队）便有50000人左右，其中直接在军统局领薪的有25000多人，其余半数分散在各公开单位。
国防部保密局局长毛人凤
戴笠在世时，对军统局实行家长式管理，由于戴的威望和资历，他在军统内部可以说一不二 。戴笠还利用各种资源，安排军统内部人员，让他们也有个好的出路。戴笠死前，还曾积极谋取海军总司令和全国警察总监之职，以便安插军统各级人员。
而戴笠死后，面对如此庞大的机构和人员，军统内部可能接班的郑介民、毛人凤和唐纵都无能力继续维持，最后只好缩编、改制。
二、1946年政治协商会议后，中共和各民主党派强烈要求国民党政府取消特务统治，解散特务机构，迫于这些压力，蒋介石将军统局和中统局改组。
三、戴笠在世时，由于得到蒋介石青睐，所以在处理某些事情时飞扬跋扈，得罪了国民党内一些高官要员，比如陈诚、何应钦等人，他们要求改组军统局，限制其权力，这也是军统局改组的一个重要原因。