安图历史悠久，远在旧石器晚期就有人类在这里繁衍生息。中原地区进入奴隶制社会时，县境居住着秽貊族系的北沃沮人。
西晋时， 县域为肃慎人居地。
汉元封三年（公元前108年），汉武帝设乐浪、临屯、真番、玄菟等4郡，安图为玄菟辖地 。
汉建昭二年（公元前37年），高句丽征服北沃沮并统治延边，安图为其辖地 。
唐圣历元年（698年），粟末靺鞨首领大祚荣建震国，后改为渤海国，县境为中京显得府辖地，设卢州（今明月镇一带）、兴州（今二道镇宝马一带）。
后唐天成元年（926年），契丹灭渤海，改国号为辽，安图为辽东京道长白山女真大王府辖地。
金于天会三年（1125年），灭辽，安图为金上京海兰路会宁县辖地。1215年（金贞祐三年）辽东宣抚使蒲鲜万奴在东京（今辽阳）叛金称王，国号大贞。
金贞祐四年（1216年），被蒙古和契丹人击败东逃，在南京（今和龙县城子山山城）建都，改国号“东夏”，安图为其南京路辖地。
元太宗六年（1234年），安图归辽阳行省开元路。
明洪武十八年（1388年），灭东夏国统一东北，安图为奴儿干禾屯吉卫辖地，治所在今万宝镇古城村。
清顺治元年（1644年），清军主力入关后 ，清廷视长白山一带为其祖先发祥地 。
康熙十六年（1677年），清廷将兴京以东，伊通州以南，图们江以北划为禁地。安图为长白山腹地，且盛产人参，封禁尤严。咸丰年间，山东、河北流民始入禁区谋生。
光绪七年（1881年），正式开禁，封禁长达200余年。1908年（光绪三十四年），县境五道白河以北至牡丹岭一带为桦甸县辖地，以南至长白山一带为长白府辖地，荒沟岭以北至哈尔巴岭一带为延吉县辖地。
自清同治七年（1868年）之后，韩民越垦逐渐增加。至1909年（宣统元年），仅二道江一带达280 余户。甲午战争后，日本为鲸吞中国领土，制造“中韩边界”问题，在边境地带屡生事端，而长白府辖域过广，治理难周。为对长白山一带“实边”，经理疆界，遏制日本的侵略 。
宣统元年十月二十四日（1909年12月6日），东北三省总督锡良奏请 ，于图们江上源 ，自红旗河以西，北循省界，南至石乙水，中抱布尔瑚里至长白山处，添设县治 。1910年1月16日（同年十二月初六日）获准，命名安图，意为安定图们江界，保国安民 。拟治于红旗河口 ，后因经费不足 ，改于娘娘库（今松江镇 ），隶于奉天省长白府 。
1913年安图县属奉天省东路辖，1914年6月属奉天省东边道 。1929年1 月隶于辽宁省，为三等县。东北沦陷后，1932年属伪奉天省，为丁等县。1934年12月1日划归间岛省，1943年10月属伪东满总省间岛区域，1945年复归伪间岛省 。
安图县于1946年3月解放，隶于吉东分省。同年5月吉东分省划分为延边、吉东（后改为吉敦）两个专区，安图属吉东专区。1947年10月11日，吉敦、延边两个专区合并称吉东专区，专署驻延吉，安图属之。1948年3月吉东专区改为延边专区 。1952年9月3日，延边朝鲜族自治区成立 ，1955年自治区改为自治州，辖安图至今。
