如果检查时肠道仍有许多粪便，就会影响进镜和观察，甚至不能完成整个大肠检查。因此，检查前肠道的清洁准备工作十分重要。
建议如下：检查前一日晚餐进半流质少渣食物，如稀饭等，不吃蔬菜及西瓜等带籽水果。于检查前4小时左右，成人50g、儿童25~35g的硫酸镁粉加温开水1000ml口服，此后1小时内口服温开水2000~2500ml。一般半小时左右即开始排便，连泻5~7次既可基本排清大肠内粪便。
部分患者在肠道准备过程中会发生呕吐，这可能与硫酸镁的刺激及短时间内大量饮水有关，可将硫酸镁混入饮料后口服，然后缓慢口服白开水，以感到明显腹胀为标准，若饮水结束4小时后扔未排便，则为无效，即应前往医院进行清洁灌肠。
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