(一) 空气过滤
空气过滤是利用物理阻留的方法去除空气介质中的尘埃和微生物。过滤机制主要是空气中的微生物(尘埃，水雾滴)等随气流运动直接碰撞于过滤纤维(滤材)上，或由于重力作用沉除而粘附于纤维(滤材)上，或由于静电作用(纤维带有静电)空气中的微粒被吸附于滤材上。
空气过滤使用的过滤介质原则上要求其孔隙小于微生物中的细菌或孢子，发挥对空气中颗粒的拦截作用。空气通过时，微生物被阻留在介质一侧。有的过滤介质的孔经间隙大于微生物，为了达到所需的除菌效果，介质必须有一定的厚度,发挥对空气中颗粒的拦截作用。
食品制造中，特别是包装工序，应该进行无菌(净化)包装时，要求有净化的环境(净化室)，共中的净化装置对空气的净化效果是十分明显的。这种净化室是把经过过滤后的空气再净化进入特定的环境，经热杀菌后的食品进入该环境冷却后包装。这里的食品包装净化环境相当于实验室内的超净工作台，可做到无菌包装。
(二) 紫外线消毒
紫外线消毒是指紫外线作用于微生物细胞DNA，破坏DNA分子键，使其失去复制能力或失去活性，进而导致微生物的死亡。
紫外线(UV)消毒是一种高效、安全、环保、经济的技术，有广谱杀菌作用，可杀死包括细菌、结核杆菌、芽胞和真菌在内的多种微生物，而且几乎不产生任何消毒副产物。原则上有一切食品生产加工经营场所都可以安装紫外线杀菌灯进行空气消毒。
微生物被紫外线杀灭所需要的剂量取决于紫外光强度和照射时间。另外紫外线的杀菌效果受到温度(适宜20-40摄氏度)，湿度(60%)以下、悬浮物、有机物等的影响。但过量的日光紫外线照射，可对人体的皮肤、眼睛以及免疫系统等造成伤害。
紫外线辐照受空间面积、悬挂高度，自身功率有关，一支30w杀菌灯的有效灭菌空间范围应小于30立方米，一般认为，每一立方米空间的杀菌灯功应大于1-1.5w。灯管的悬挂高度应小于2.5米，一些使用单位灯管悬挂高度大于2.5米，甚至大于3，4米的都有。紫外线的辐照强度与辐照距离几乎成反比，悬挂太高，势必影响灭菌的效果。
紫外线对空气的消毒多用固定式照射法。紫外线杀菌属于静态消毒方式，开启紫外线灯时，全部人员应该离开消毒现场，以免造成人体伤害；建议将紫外线消毒机的控制开关安装在室外，人员全部出去后开启，反之关闭。对有人在的场所，不宜有暴露式照射，可改用通过式照射，即设有紫外线杀菌风筒，紫外线风筒是用2～4支紫外线灯管装于直径30cm的铝制圆筒内，在一端装风扇。这种装置依靠风扇使空气通过紫外线风筒将空气消毒。对室内局部空气消毒时，如各种食品的分割、灌装、包装、装罐、等操作室内空气，对餐馆、饭店的冷(凉)拼间等可该工序部位可玻璃、塑料等建筑材料包围起来，其间安装杀菌紫外线灯。
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