股权变更需要缴纳的税种包括个人所得税、印花税和增值税。
详细解释如下：
1. 个人所得税：当股权发生变更时，出让方需要就其转让股权的所得缴纳个人所得税。这主要是基于股权转让取得的收入与出让方原股权成本之间的差额，属于其个人的财产转让所得。税率根据所得额的不同而有所调整。
2. 印花税：在中国，股权变更属于产权转移书契税的应税范围，因此需要缴纳印花税。根据印花税法的相关规定，买卖双方需要按照交易金额的特定比例缴纳印花税。印花税的税率相对较低，但确保了交易的透明性和公平性。
3. 增值税：在某些特定情况下，如公司之间的股权变更涉及到资产转让或业务重组等，可能需要缴纳增值税。增值税是对商品和服务增值部分征税的一种税，但在股权变更中是否涉及增值税以及具体税额多少还需根据实际情况判定。另外要注意的是，关于增值税的政策会根据不同的地域和情况有所不同，可能有所差异或免除增值税的政策优惠。例如有的情况下并购时针对特殊类型的股东会提供税收减免的政策优惠。建议在具体的股权变更事件中向税务专家咨询以确保税务处理正确无误。因此，涉及税务的专业性较强，建议在办理股权变更前咨询专业的税务人员或机构以确保税务处理得当。在进行股权变更时，了解并遵守相关的税务规定是非常重要的，以确保交易的合法性和合规性。