马来西亚海运费通常以货物的体积或重量为基础进行计算。具体的计算方法可以划分为这几种：体积计算法、重量计算法、混合计费等。
一、体积计算法
按体积计算运费时，其算法公式为：运费=体积（立方米）×运费率（美元/立方米）。这种计费方式主要针对的是大而轻的货物，包括各种类型的泡沫塑料、灯具等。
二、重量计算法
按重量计算时，其算法公式为：运费=重量（吨）×运费率（美元/吨）。一般是根据货物的重量或大小，选择运费较高的一个计算运费。
三、混合计费
需要混合计费时，则需要同时考虑货物的体积和重量综合考虑，计算出运费。在集中托运的情况下，同一运单下可能会有多件货物，包括轻货和重货。此时，该批货物的计费重量是实际重量和体积重量，以较大者为最终计费重量。
影响马来西亚海运费的因素：
1、距离：运输距离是决定海运费用的重要因素。距离越长，所需时间和能源越多，运费也就越高。
2、货物的性质：货物的性质包括密度、体积、重量等。不同性质的货物在运输过程中所需的空间和能源不同，因此运费也会有所不同。
3、运输方式：海运通常分为整箱运输和拼箱运输。整箱运输即一个集装箱装载一个客户的货物，而拼箱运输则是多个客户的货物装载在一个集装箱内。整箱运输的运费相对较高，但货物的安全性较高；拼箱运输的运费较低，但货物的安全性相对较低。
4、市场竞争：航运市场的竞争状况也会影响海运费。如果市场竞争激烈，船运公司可能会降低运费以吸引客户；如果市场竞争不激烈，船运公司可能会提高运费以增加利润。
5、燃油价格：燃油价格是影响海运费用的另一个重要因素。燃油价格的波动直接影响船运公司的运营成本，因此也会影响海运费用。
6、其他因素：其他影响海运费用的因素包括天气条件、目的港的拥堵情况等。例如，恶劣天气或目的港拥堵可能导致运输时间延长，从而增加海运费用。
以上内容参考：百度百科-马来西亚
此外，还有一些其他因素也会影响到海运的收费，例如货物的特殊性质，需要特殊运输设备或特殊操作的货物可能会产生额外的费用。同样地，一些额外的服务，如报关和仓储等也可能会增加费用。因此，在选择海运方案和货运公司时，需要综合考虑所有因素，并与货运公司进行详细沟通，了解清楚他们的收费标准和服务内容。