日本的文化渊源比较复杂，属于日本土著文明（大和文明）、
朝鲜半岛文明（朝鲜文明）、大陆文明（
中华文明）、南洋文明（
东南亚文明）、西洋文明（欧美文明）相混合的文明。其中后四种属于外来文明。
朝鲜文明由于
地理位置的接近，最早影响日本。比如日本流行过的“日本文明朝鲜来源论”“日韩同源”理论，其来源也正源于此处。
中华文明是对古代及近代日本影响力最为巨大的文明，从唐初一直到
明治维新之前，日本一直在做中国的学生。从文字、制度、礼仪、宗教等各个方面都形成深远影响。
南洋文明主要是对日本南部、西南部地区形成影响，其原因是历史上日本与东南亚各地通商，逐渐受到
琉球、菲律宾等地的影响。日本人中部分含有南洋矮黑人的基因，其原因就在于此。
西洋文明是从15世纪以后开始兴起的，最初的学习对象是荷兰，也叫“兰学”。随着中华文明的逐渐衰败，西方殖民者的到来使得日本对于西洋文明感兴趣的人越来越多。明治维新以后西洋文明开始取代中华文明占据主流，并在1945年日本战败以后达到顶峰。现在的日本基本上已经完全追随西洋文明的脚步。