合作医疗和医保不是一样的。
医保一般指基本医疗保险，是为了补偿劳动者因疾病风险造成的经济损失而建立的一项社会保险制度。通过用人单位与个人缴费，建立医疗保险基金，参保人员患病就诊发生医疗费用后，由医疗保险机构对其给予一定的经济补偿。
合作医疗，是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
农村合作医疗是由我国农民自己创造的互助共济的医疗保障制度，在保障农民获得基本卫生服务、缓解农民因病致贫和因病返贫方面发挥了重要的作用。
农村合作医疗和社保有冲突
农村合作医疗和社会保险中的医疗保险是有冲突的，不能同意享受这两项待遇。所以，没有必要同时参加。建议注销掉合作医疗，只参加职工医疗保险。农村合作医疗每年交费一次，不产生个人账户余额，所以不存在转移费用的问题。
如果参加了农村养老保险，也与社会保险中的养老保险相冲突。建议停止交纳农村养老保险。至于农村养老保险已交纳的份额转移问题，可到当地的社会保险经办机构去详细咨询。据我所知，现在国家还没有相关的法律来处理这个问题。
以上内容参考百度百科-新型农村合作医疗
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