云中子要杀妲己，本来就是元始天尊授意下的结果：他要借着这件事，来试探女娲对“封神大战”的态度。明代神魔小说封神演义，一直以来都被认为是构建我国神话体系的重要支柱之一。书中以“阐截大战”的流血纷争，天界冲突为主线，勾勒出了一个栩栩如生，荡气回肠的神魔世界。书中妲己曾经在女娲娘娘的驱使下祸乱商朝国纲，险些被云中子所杀。云中子到底有多大的胆子，敢如此挑衅女娲娘娘？
我们从另一个角度讲，如果云中子没有“靠山”，他又怎么敢去打一位高高在上的“圣人”的脸？云中子出身名门，是阐教二代弟子的佼佼者，更是元始天尊最疼爱的弟子之一：而元始天尊一向以城府深沉，一步三算著称。这件事，表面上看，是云中子不知轻重，得罪了女娲；从深层次考虑，肯定是元始天尊有意让云中子做出此举，从而试探女娲对“阐截两教”即将展开的封神之战的态度。
这件风波的结果是：女娲并没有什么反应。元始天尊从而明白了，这位天道圣人，妖族领袖，在“封神”事件上秉持的姿态是“事不关己，高高挂起”，从而他才在缜密谋划下，正式开展了“封神”的第一步。
因为他是仙人，自然看不得妖怪祸乱人间，而女娲娘娘知道商汤命数已尽，云中子就算想要顺延商汤的命数也做不到，不必为此去追究这仙人的罪过。女娲娘娘是天界的上神，在封神中，她的神像被纣王侮辱，因此便打算放出狐妖来终结这商汤的命数。这狐妖可以说是女娲娘娘的人，她为祸人间也是接到了女娲娘娘的命令。云中子既然能看到的朝歌妖气重，其他的神仙也能发现，可是除了云中子外，并没有其他仙人去除妖。
其他神仙当然不是看不到，而是不想管。神仙居于神界，对人间之事不需要管，也不愿意管。更何况，这些神仙都能算得出来，女娲娘娘对纣王的行为大怒，这商汤的气数已尽，何必去管狐妖在商汤作乱。而云中子与这些仙人不同，他应该是不忍心狐妖为祸世间，不忍心看这些无辜之人受害。云中子亲自前去朝歌，见了纣王，将枯松木制成的木剑送给了纣王。叫纣王挂于楼上，除去妖邪。纣王虽然相信他的话，将剑挂上了楼，却在妲己大病之后，又将木剑毁掉了。
云中子有心救商汤，可惜纣王却被妲己迷惑，不相信美人是妖怪，更不愿意失去美人。因此云中子便明白了，这商谈命数已尽，无论他做什么都改变不了。云中子也算出来西周即将取代商汤，更算出来之后众神要遭封大难，姜子牙出山封神。云中子只能叹息，他无力更改这些未来的命数。女娲娘娘大怒，便引起了商汤命数的改变。云中子只是一个仙人，根本更改不了这天命。
总的来说，云中子杀妲己，是为了除妖以尽到仙人的责任，而女娲娘娘要灭商，云中子阻止不了，更不可能更改商汤的命运。