血液净化中心
杭州市第二人民医院的血液净化中心于2008年启用，作为萧山区首个在基层医院设立的透析中心，它为周边需要透析的患者提供了极大便利。该中心装备有国际领先的血液净化装置和反渗透水处理设备，每个透析床前都配有液晶电视和耳机，让患者在治疗过程中可以享受舒适的环境，观看自己喜欢的节目。中心由肾内科专家杨建民院长主持，他在处理“血透疑难病症”上享有盛誉，尤其在萧山乃至全省都有较高的知名度。
手外科
隶属于骨科的手外科位于门诊综合楼五楼，拥有31张床位和18名医护人员。科室配备了先进设备，如C臂机和电脑牵引床，负责萧山东片地区的创伤骨科急救和治疗。手外科自2006年成立以来，专注于四肢显微外科修复重建，包括急诊手足外伤、断指再植和颈肩痛等疾病的治疗。与省人民医院合作后，手外科门诊每周五有主任医师谢庆平坐诊，为当地百姓提供高质量的手外伤和颈肩痛服务。
肝胆外科
肝胆外科隶属于外科的多学科综合科室，设有腹腔镜中心和碎石中心。外科病区位于四楼，设有32张床位，配备了德国wolf腹腔镜等先进设备。自2002年以来，科室已成功实施200多例腹腔镜胆囊切除手术，深受患者好评。
杭州市第二人民医院 ( 杭州师范大学临床医学院、杭州师范大学附属医院 ) 创建于1954年，是杭州市城北一所融医疗、科研教学、预防保健为一体的三级甲等综合性医院，肩负着临床医疗和医学教学双重任务。