1、办公室
负责综合协调局机关重要党务、政务、事务工作；负责起草教育局工作计划、总结及有关文字材料的综合；负责党委会、局务会、局长办公会及局级重要会议的组织安排和会议议定事项的督办；
负责上级部门及局领导交办重要事项的督办工作；组织协调国家目标办下达的各项目标督办及总结汇报工作；负责文秘、机要、档案、信访、保密、保卫、信息、后勤管理工作。
2、政策法规科研管理处
负责全国教育综合改革与发展战略的研究并就重大问题进行政策调研；规划并起草地方性教育法规、规章制度和政策；负责全国教育系法制宣传、教育行政执法监督和行政复议工作。
国家教育科学规划领导小组办公室在政策法规科研管理处，负责全国教育科研工作；负责学会管理工作。国家语言文字工作委员会办公室是国家语言文字工作委员会的办事机构，设在国家教育局，与政策法规科研管理处合署办公。
主要职责是：贯彻执行国家关于语言文字的方针、政策、法规，拟定国家语言文字工作规划和实施办法，宏观管理和指导全国各行各业语言文字工作。
3、人事处
负责全国教育系统人事管理、教师轮换、表彰奖惩工作、人事管理体制改革工作；负责教师资格认定工作；负责局机关及直属单位科级干部的任免和备案；
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