1、菏泽市教学研究室（挂菏泽市教育科研所牌子）
职责范围：深化教学改革，提高教学质量。全市中小学、学前、特殊教育、教学研究和业务指导、管理。
在完成原工作目标的前提下，增加以下职责：
（1）受市级教育行政部门委托，研究制定本地区教育科学研究规划，确定本地区教育科学研究规划重点课题，并进行相应的管理、指导、验收和评估；承担同级教育科学规划领导小组办公室日常工作。
（2）参与本地区教育发展战略研究，组织、协调教育科学研究力量开展重大课题攻关。
（3）指导、检查、评估本地区教育科研工作，负责组织评审中等以下教育优秀科研成果。
（4）总结和推广先进的教改经验和教育科研成果。
（5）组织教育科学理论的学习、普及和应用，培训教育科研骨干教师队伍。
2、菏泽市职业教育教学研究室
职责范围：贯彻国家教育方针，提高职业教育教学质量。职业教育教学研究管理、指导、改革试验、服务；职业教育评价、师资培训。
3、菏泽市招生委员会办公室（挂菏泽市留学服务中心牌子）
职责范围：负责全市大专、中专、成人、研究生招生工作。在完成原工作目标的前提下，增加以下职责：
（1）提供出国留学政策咨询服务，办理学生出国留学手续并做好审核、备案工作，引导和规范全市出国留学市场；
（2）开展与统筹管理中外学校交流和合作办学项目。
（3）负责全市高中分流学生的出国留学预科教育及输送工作；
（4）加强对外联络，统筹管理外国留学生来菏泽就读事宜；
（5）组织学生到国外学习，开展各种培训工作，承办国外教育展览。
4、菏泽市高等教育自学考试办公室
职责范围：通过国家考试促进广泛的个人自学和社会助学活动，造就和选拔德才兼备的专门人才。全市高等、中等教育自学考试报名、宣传及组织考试，指导社会助学活动，相关等级证书考试。
5、菏泽市教学仪器站
职责范围：为实验环节教学和训练提供保障。全市学校实验室规划、建设，教学仪器设备开发、供应，拟定实验教学及实验室人员配备标准，组织实验人员培训。
6、菏泽市电化教育馆
职责范围：负责全市中小学校现代远程教育和信息化工作；电化教育、电化教学研究工作；电教人员和教师电化教育理论和技能培训。
7、菏泽市学前教育管理办公室
职责范围：负责全市幼儿教育工作。拟定全市幼儿教育事业发展规划、进行业务指导、幼儿园园长和教师的培训、业务考核工作。
8、菏泽市学生资助管理中心
主要承担以下职责：
（1）建立全市高校，中等职业学校接受资助学生信息管理系统，准确、及时汇总并上报接受资助学生的信息；
（2）承担全市高校、中等职业学校奖学金、助学金、勤工助学、学费减免及全市各级各类学校学生资助信息统计工作；
（3）根据年度助学贷款计划，接收、审核市属高校及中等职业学校的贷款申请报告，核准各校贷款申请额度；
（4）接收市财政拨付的资助资金，统一管理市财政拨付的贷款贴息；
（5）协助经办银行监督、管理贷款的发放、使用和回收等；
（6）做好资金的管理和发放工作，指导、监督高校、及职业学校认真做好评审和资金发放工作。
9、菏泽市教育局勤工俭学办公室
职责范围：校办企业管理；校园经济开发与管理；素质教育基地创办与管理；开发教育内部市场、为教育教学服务；进校图书的把关与管理。
10、菏泽市教育局函授处
职责范围：负责全市教育系统干部职工的业务培训及学历提高。
