咱们先来看看个税改革前，是怎么规定的：
个人在中国境内取得两处及以上工资、薪金所得，由扣缴单位各自完成扣缴申报，基本减除费用以及社保公积金专项扣除费用，只能选择一个扣缴单位减除。
个人在次月的15日内履行自行申报义务，税款多退少补，一般情况下补税的情况比较普遍。
个税改革后，将工资薪金纳入综合所得按年计税。
在这个前提下，（居民）个人取得两处及以上工资薪金所得，由扣缴单位预扣预缴税款，分别扣除基本减除费用标准（5000元/月），但社保公积金专项扣除费用、专项附加扣除费用，仍只能选择一个扣缴单位扣除。
等到年终后，将两处及以上取得的工资薪金分别并入综合所得，如果综合所得符合汇算清缴的情形，由纳税人于次年的3-6月，自行汇算清缴申报，应纳税款多退少补。
纳税人如何判断是否需要汇算清缴呢？
很简单，就是将自己两处及以上取得的工资、薪金合计，再减除单位代扣代缴的社保公积金专项扣除，看看是否超过6万元；
超过了，就需要汇算清缴，不超过，可自行决定是否汇算清缴。
根据政策规定，居民个人2019年取得的两处及以上工资薪金所得，无需自行按月申报。
若符合国家税务总局公告2018年第62号文件规定情形——“从两处以上取得综合所得，且综合所得年收入额减除专项扣除后的余额超过6万元”，则需要办理汇算清缴。
需要办理汇算清缴的纳税人，应当在取得所得的次年3月1日至6月30日内，向任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报，并报送《个人所得税年度自行纳税申报表》。
因此，取得两处以上工资薪金所得，应该由两家公司每月分别预扣预缴，个人年终进行汇算清缴。
同时，51个税提醒：两处以上取得的工资薪金所得，不可以享受两次专项附加扣除！
纳税人同时从两处以上取得工资、薪金所得，并由扣缴义务人办理上述专项附加扣除的，对同一专项附加扣除项目，一个纳税年度内，纳税人只能选择从其中一处扣除。
所以，在2020年个人所得综合所得汇算清缴来临之前，纳税人很有必要核查一下：有没有专项附加扣除重复申报的情况！
若有，请及时修改！以免因虚假申报，影响个人信用！
另外，非居民个人2019年取得的两处及以上工资薪金所得，应当在取得所得的次月15日内，向其中一处任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报，并报送《个人所得税自行纳税申报表（A表）》。
【重磅消息】
根据《关于办理2019年度个人所得税综合所得汇算清缴事项的公告》（国家税务总局公告2019年第44号）规定如下：
依据税法规定，符合下列情形之一的，纳税人需要办理年度汇算：
（一）2019年度已预缴税额大于年度应纳税额且申请退税的。包括2019年度综合所得收入额不超过6万元但已预缴个人所得税；年度中间劳务报酬、稿酬、特许权使用费适用的预扣率高于综合所得年适用税率；预缴税款时，未申报扣除或未足额扣除减除费用、专项扣除、专项附加扣除、依法确定的其他扣除或捐赠，以及未申报享受或未足额享受综合所得税收优惠等情形。
（二）2019年度综合所得收入超过12万元且需要补税金额超过400元的。包括取得两处及以上综合所得，合并后适用税率提高导致已预缴税额小于年度应纳税额等情形。
（一）从两处或者两处以上取得工资、薪金所得的，选择并固定向其中一处单位所在地主管税务机关申报。
（二）从中国境外取得所得的，向中国境内户籍所在地主管税务机关申报。在中国境内有户籍，但户籍所在地与中国境内经常居住地不一致的，选择并固定向其中一地主管税务机关申报。在中国境内没有户籍的，向中国境内经常居住地主管税务机关申报。
（三）个体工商户向实际经营所在地主管税务机关申报。
（四）个人独资、合伙企业投资者兴办两个或两个以上企业的，区分不同情形确定纳税申报地点：
1.兴办的企业全部是个人独资性质的，分别向各企业的实际经营管理所在地主管税务机关申报。
2.兴办的企业中含有合伙性质的，向经常居住地主管税务机关申报。
3.兴办的企业中含有合伙性质，个人投资者经常居住地与其兴办企业的经营管理所在地不一致的，选择并固定向其参与兴办的某一合伙企业的经营管理所在地主管税务机关申报。
（五）除以上情形外，纳税人应当向取得所得所在地主管税务机关申报。本回答被提问者采纳