法律分析：自建房父亲不在了不动产权证申请房屋所有权变更登记，应当提交下列材料：
1、登记申请书；
2、申请人身份证明；
3、房屋所有权证书或者房地产权证书；
4、证明发生变更事实的材料；
5、宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明；
6、其他必要材料。申请村民住房所有权转移登记的，还应当提交农村集体经济组织同意转移的证明材料。农村集体经济组织申请房屋所有权转移登记的，还应当提交经村民会议同意或者由村民会议授权经村民代表会议同意的证明材料。
法律依据：《中华人民共和国建设部房屋登记办法》第十三条 共有房屋，应当由共有人共同申请登记。
共有房屋所有权变更登记，可以由相关的共有人申请，但因共有性质或者共有人份额变更申请房屋登记的，应当由共有人共同申请。