连锁、分公司、分店从概念上、组织形式以及覆盖范围上各有不同，具体区别如下。
一、三者概念不同
连锁是指投资创业者使用某一品牌，在品牌旗下店面的加盟模式。是一种商业模式。连锁商业模式分为直营和加盟等多种形式，分为直营店和加盟店。
分公司是指在业务、资金、人事等方面受总公司管辖而不具有法人资格的分支机构。分公司属于总公司分支机构，在法律上、经济上没有独立性，不具有企业法人资格，仅仅是总公司的附属机构。
分店是主店之外下设的同类店，在经济上有附属关系，在管理上有一定的隶属关系，在品牌和产品上有授权关系。
二、三者组织形式不同
分店与分公司实际上都属于分支机构，不具备独立法人地位。但是两者的区别主要是企业组织形式的不同，分公司是公司制企业的分支机构，而分店不一定是公司制，也许是合伙，独资等其他形式。
分公司是由总公司依法设立的，分公司的主要业务活动完全由总公司决定，分公司一般是以总公司的名义并根据它的委托来进行业务活动的。另外，分公司没有自己独立的财产，分公司的所有资产全部属于总公司。分公司与总公司在经济是统一核算，其实际占有和使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表中。
连锁商业模式分为直营和加盟等多种形式。其中托管连锁模式是经过验证的当今连锁企业最先进的商业模式，具有高稳定性，低风险，快扩张的特点。
三、三者的覆盖范围不同
连锁有直营和加盟等多种形式，分为直营店和加盟店。所以连锁的覆盖范围很广，并且更具有品牌效益，富有专业性。有竞争力的连锁品牌由于发展前途较好，加盟要求自然也高。所以，加盟条件越严格的品牌往往有较完整的加盟制度以及较强大的财力与实力，反而较有能力保证加盟者获利。正因为如此，越有信誉的连锁企业，挑选加盟者时把关就越严谨。
分公司的覆盖范围次于连锁。分公司属于总公司分支机构，在法律上、经济上没有独立性，不具有企业法人资格，仅仅是总公司的附属机构。分公司是相当于母公司、子公司来划分的概念。分公司没有自己的名称、章程，没有自己的财产，并以总公司的资产对分公司的债务承担法律责任。
分店的覆盖范围最小，并且进入门槛低。连锁店是指众多小规模的、分散的、经营同类商品和服务的同一品牌的零售店。在总部的组织领导下，采取共同的经营方针、一致的营销行动，实行集中采购和分散销售的有机结合，通过规范化经营实现规模经济效益的联合。
参考资料来源:
参考资料来源:
参考资料来源: