蒙药学专业（代码：100811W），作为医学门类下的药学分支，致力于培养具有深厚蒙医药学理论基础和实践技能的专业人才。该专业的核心目标是培养学生具备蒙药的基础知识，如蒙医学和药学知识，能在蒙药生产、检验、流通和研发领域中从事蒙药鉴定、制剂设计、植物栽培以及临床用药指导等工作。
在学习过程中，学生将掌握以下关键能力：
主要课程包括蒙医学基础、蒙药学、蒙医方剂学、蒙药药用植物学、蒙药化学、蒙药制剂学、蒙药鉴定学、蒙药炮制学、蒙药药剂学、蒙药药理学、蒙药分析、蒙药资源等，实践教学环节如生产实习和毕业论文设计，共安排22周。
蒙药学专业与药学（100801）、中草药栽培与鉴定（100804W）、中药学（100802）、药物制剂（100803）、中药资源与开发（100806）、中药制药（100814S）、应用药学（100807）以及药事管理（100810）等专业有所关联，主要学府有内蒙古民族大学（10136）和内蒙古医学院（10132）。
蒙药是蒙医防治疾病的有力武器。药源有植物、动物、矿物，仅典籍所载已达2000种以上。在临床应用中大部分采用中药材，只是在加工制作方法和用法上与中医不同，蒙医主要以蒙医基础理论为指导，依据蒙药药理学原理配伍制剂。其药物具有三小（毒性小、副作用小、剂量小）、三效（高效、速效、长效）、五方便（采集、生产、携带、服用方便）的特点。