毕业论文抽查格式有问题可能会论文被拒绝、严重影响评分、学术不端行为认定等。
毕业论文抽查是高校对于学生毕业时提交的论文进行审查的一个重要环节，其目的是为了保证学生在毕业时提交的论文符合学术规范，没有抄袭等问题。
1、论文被拒绝：如果毕业论文的格式有明显的问题，比如标题、摘要、目录不规范、正文格式混乱等，会导致论文被退回并要求重新修改。可以说，论文的格式是最基础、最简单的部分，如果格式无法达到要求，则很难通过审查。
2、严重影响评分：除了被退回的可能，毕业论文抽查格式有问题也会严重影响最终的评分。论文的格式规范也是论文评价中的一部分，如果格式不规范，则会让评阅人员对该论文的整体印象降低，从而影响最终得分和学位授予结果。
3、学术不端行为认定：如果毕业论文的格式过于简单、疏漏，甚至与他人论文格式相似，抽查结果会显示该论文存在抄袭、剽窃等学术不端行为，可能导致论文被学校认定为不合格，甚至引起学术不端的处罚处理，严重还可能导致毕业无法顺利完成。
因此为了避免以上情况，学生在撰写毕业论文时，应认真阅读学校的论文格式规范和撰写指南，并充分准备。对于自己不熟悉的格式，应该及时咨询导师或同学，避免个人理解和解释影响格式的规范性。
在完成论文后，也应该进行格式检查，使用专业软件对标点符号、字体、字号、行间距、首行缩进、正反文等进行统一调整，避免格式混乱和不规范的现象出现。对于论文的内容和结论，也应该保持独立思考，坚守自己的学术诚信，避免出现抄袭、剽窃等违规行为。
毕业论文的重要性
1、提高研究能力：毕业论文的撰写过程需要具备很强的研究能力，需要毕业生深入了解自己所学领域的知识，并进行独立的思考和分析，寻找到一个自己成功的论题以及针对性的解决方案。这个过程中，毕业生不断提高自己的学科能力和解决实际问题的能力。
2、提高表达能力：论文撰写过程中，毕业生需要清晰地表达研究的目的和方法，准确提出问题，并且从论据和分析，结论等方面进行全面分析探讨，还需要有严谨的文献引证和学术论证。撰写毕业论文是对毕业生表达能力的一大考验，也是提高表达能力的重要途径。
3、巩固学术基础：撰写毕业论文需要毕业生在学习、查阅文献、思考方案和总结等方面进行全面学习和反思，巩固学术基础。在撰写的过程中，毕业生不仅可以系统地掌握某个学科领域的核心思想，还可以逐步提高自己的学术素养和学术修养。
其次，目前，主流的论文查重系统如知网、paperfree等在检测抄袭和剽窃方面表现出色，但对格式问题的识别能力有限。因此，尽管毕业论文作者遵守了论文格式要求，仍有可能被查重系统误判为抄袭。为此，学术界需要进一步完善论文查重系统的功能，提高其对格式问题的识别能力，以确保论文查重结果的准确性和公正性。
最后，包括加强学术诚信教育、提高论文查重系统的技术水平和加强学术维权意识等。只有通过多方合作，才能有效预防论文抄袭和剽窃现象的发生，维护学术界的学术声誉和研究成果的正当性。
总的来说，毕业论文格式规范性可以在一定程度上影响论文查重结果。格式规范的论文更容易通过查重系统检测，避免抄袭嫌疑；而格式混乱的论文则可能被误判为抄袭或引用不当。因此，研究生在写作毕业论文时应当注重格式规范，同时加强论文写作技巧和引用规范，以确保论文质量和避免不必要的查重风险。