这是一件很正常的事情，走一步看一步，尽量配合吧，权力乃身外之物，没必要过分计较，他说得对，按他说的办，没什么大不了的！
科长提拔为本部门领导，很可能继续分管原来科室的工作，因为工作熟悉、人员熟悉，有些事情过问的多一些，其实也是正常现象，具体我觉得要看以下几点：
第一：领导的意图是什么
如果你领导是升在你之上，就是管辖着你，然后你管着你们部门，那么他插手你部门的工作，也是容易让人理解的，尤其如果现在你的下属曾经是你的平级，你估计工作有不会很容易开展。
我现在的情况和你类似，不过是我的领导要退休了，成为了我们公司的顾问，但是领导仍然不想放手，一天到晚管着我们这边。但是我们大领导的意图是很明显的，我们只是需要我退休的领导做好后面的交接工作就好了，另外我们几个同事其实也看不惯我们这个已经退休的领导，毕竟他在的时候，其实一直在压榨我们几个，所以大家都不开心。当然我大大领导也知道的，我们都在等这个时机而已。
所以你必须要了解你大领导的想法，当然最差的就是大领导默许这一切。如果是这样，既然你已经是科长，那就意味着有科长的工资，忍一下吧，因为你领导他自己也有自己的管辖范围，以后他自己的事情，总会忙起来，所以总要让你自己开动干活。
第二：抓紧机会学习
其实我有时觉得虽然我们都已经被提拔了，但是还是有可能还没有准备好。所以这个时间点，不妨放下自己的姿态，静观其变，同时也在这个时间段，积攒属于你自己的力量。
因为你新上任，你的下属他们的心意如何，也是值得探讨的一个问题，沉下心来，把工作做好，然后默默的争取这些人的支持，我相信你以后的工作会做得越来越顺利。任何事物都需要一个过程，原领导再插手再延续也不能没完没了，毕竟你现在是科长，你当科长不是他定的，所以工作有了大的矛盾，他还是要支持你的。
总结：做好工作日志，记住时间节点，凡事有先来后到，一般有个继承。要明确你接手以后的工作，就由你负责，他安排事宜，最好要有书面的东西。否则可以让他直接安排给经办人，按照规矩，你科的经办人办理过程中会征求你的意见，这时候你可以找他征求他的意见，聪明的领导会知道怎么回事。