主要区别是，性质不同、作用不同、 设置地点不同，具体如下：
一、性质不同
1、路肩
路肩指的是位于车行道外缘至路基边缘，具有一定宽度的带状部分（包括硬路肩与保护性路肩）。
2、应急车道
是指与左侧行车道相邻，包括硬路肩在内的宽度3米以上，有效长度大于或者等于30米，可以满足机动车停靠需要的路面部分。
二、作用不同
1、路肩
为保持车行道的功能和临时停车使用，并作为路面的横向支承。
2、应急车道
在紧急的情况下，车辆可以在应急车道上行驶或者停车 。
三、 设置地点不同
1、路肩
高速公路、一级公路、城市道路。
2、应急车道
高速公路、城市环线。
参考资料来源：百度百科-路肩
参考资料来源：百度百科-应急车道
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