海南大学农学院主要有5个系别，分别为：
农学系简介
农学系的前身为热作系，始建于1958年，是热农大最早创立的学系之一。本系现有教师15人，其中教授2名，副教授5人，农艺师1名，讲师7名。农学系设有农学教研室和土化教研室，有农学（含热作方向）一个本科专业，种子种苗和热带作物两个高职专业，其中种子种苗专业为省高职教学改革试点专业；另有作物栽培学与耕作学的硕士点与博士点。农学系的毕业生以勤劳朴实的工作作风赢得了用人单位的一致好评。
生物技术系简介
生物技术系成立于2001年，是依托于我校作物遗传育种国家级重点学科建立发展起来的。现有教职员工26名，其中教授4名、副教授9名、讲师7名、助教1名、实验师3名、实验员2名；有博士生导师4名，硕士生导师9名；主讲教师中获研究生学位的比例达90%以上。负责生物技术、生物科学本科专业以及作物遗传育种学、生化与分子生物学、能源植物等研究生专业的教学，同时还承担外专业部分课程的教学，目前共承担课程50余门。该系下设有遗传育种和生物技术两大实验室，拥有梯度PCR仪、测序仪、高速冷冻离心机、凝胶成像系统、细胞遗传工作站、超低温冰箱和杂交炉等先进仪器设备；各种图书资料近3千册。还承担国家、省、校级多项科研课题的研究工作，主要研究方向有细胞遗传与植物品种改良、动植物分子遗传学、细胞工程、微生物感染与免疫及人类遗传病机制研究等。
农业资源与环境系简介
农业资源与环境系 设有农业资源与环境本科专业。该专业的前身是1993年设立的农业环境保护专业，1998年调整为农业资源与环境本科专业。该专业师资力量雄厚，现有教授2人、副教授4人、讲师5人，实验师2名，其中博士学位获得者3人，在读博士研究生5人。该系还拥有土壤学和植物营养学2个硕士学位点，作物栽培学与耕作学－土壤植物营养方向博士点。其中博士生导师2人，硕士生导师5人。目前在读本科生160人，硕士研究生40余人。拥有装备了先进的仪器设备教学科研实验室约1000平方米，约2000平方米的教学科研实验基地，与中国热带农业科学院、海南省环境科学研究院、海南省农业厅、海南省农业科学研究院、中海油及多个肥料企事业单位合作，建立广泛的学生校外实践基地。
草业科学系简介
海南大学农学院草业科学专业成立于2001年，同年开始招收本科生；本学科硕士点也于2004年9月开始招生。学科属于本科一级学科，现有专职教师6人，其中具有博士学位的教师2人，在读博士生1人，其余3人具有硕士学位，另有兼职硕士生导师5名。
主要研究方向：1.草坪科学与管理；2.高尔夫球场、运动场建造与管理；4.热带草地资源与生态；5.热带牧草生理生态及高产栽培技术；6.热带牧草及草坪草资源的开发和利用；7. 热带草坪草及牧草遗传育种； 8.饲草调制与加工。
动物科学系简介
现海南大学动物科学专业的前身是建于1978年的海南行政区农学院畜牧兽医专业（专科），1983年并入海南大学。现有教职员工22名，其中教授3名、副教授6名；有博士生导师1名，硕士生导师4名；主讲教师中具有博士研究生学位6人，在读博士研究生4人，其中4人为留学回国人员。
该系拥有动物科学和动物医学两个本科专业，野生动植物保护与利用硕士点一个；建设有海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室（筹）和海口市动物基因工程重点实验室。
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