清朝时期，北京的胡同与明朝相比又有了进一步地发展。清朝朱一新的《京师坊巷志稿》一书中所列的当时北京街巷胡同已有2077条，其中直接称为胡同的约有978条之多。
北京内城的街道格局仍沿袭元明时代的风格，没有多大改变。唯一比较突出的变化是内外城门附近建有许多兵营。另外，还建有许多宽阔宏敞的王公贵族府第。雍正、乾隆以后，清帝常年住西郊圆明园，王公贵族为上朝方便，多在西城建宅；同时，东城因接近商业区和通惠河码头，清晚期富商大贾多居于此，从而形成清晚期北京所谓"西贵东富"的城市社会结构。
清朝的北京外城已分为中东西南北五城，而且已演变为以各城为区，以街道胡同为主的新形式。其划分中东西南北五城的方法，正与今日北京城分为东城区、西城区相同。内城居住满、蒙、汉八旗官兵及其家属，统归八旗管辖。
北京外城的建筑风格是自东向西排列，依次为东城、南城、中城、北城、西城五区。外城之东城，东至外城东城垣，北至内城南城垣，南至外城南城垣，西至崇文门外大街。其西与南城接界。南城，自崇文门外大街西至三里河街，北至内城南垣，南至天坛。其西与中城接界。中城，自正阳门外南至永定门，东至三里河，西至石头胡同(今北京大栅栏西街西口)。其西与北城接界。北城，自宣武门外大街东至石头胡同，北至内城南城垣，南至外城南城垣。其西与西城接界。西城，自宣武门外大街西至外城西城垣，北至内城南城垣，南至外城南城垣。
清朝满族入主中原后，以文化基础相对较浅薄的少数民族统治文化底蕴较深厚的多数民族，总是心有余悸。因此，除了其他统治措施外，满清政府还强行将世代居住在内城的汉民全部赶至外城居住。这是严格执行的措施，与"剃发"、"圈地"一样都是无理可讲且不容拖延的。汉民若需到内城办事，仅限于白天，夜晚不得留宿过夜，否则将治罪。内城所有的居所主人代之以兵民合一的八旗旗人。由皇帝直接控制正黄、镶黄、正白三旗，承担对皇宫的侍卫；镶白、正红、镶红、正蓝、镶蓝下五旗由诸王、贝勒统领，担任防守内城及附近的任务。这一举措主观上既解决了进京后旗人的住所，又保卫了清皇室贵族的安全，客观上对北京老街巷的影响很大。兵民合一的八旗占据了原来的纯粹民居，改变或增加了不少具有"兵民合一"特色的街巷名称，如：××营房、头牛录、二牛录、昂邦章京胡同等；清初禁止汉人在内城居住的同时，也禁止旗人在外城居住，但在乾隆十五年的《京城全图》却有崇文门外的"正蓝旗营房"和宣武门外的"镶蓝旗营房"等地名，大概是因为下五旗要担任防守内城及附近的任务之故。在街巷胡同的命名上，还有一些是与明朝一样体现了帝都特点的做法，即以衙署命名其所在地的街巷，如：銮仪卫夹道等；以贵戚府第名之的"佟府夹道"等等。明时，北京外城除了靠近"前三门"(主要是前门外)一带人口较多外，大部分地界是很荒凉的，越往南越空旷，外城内的东西一带也很空旷。现在内城的汉民一下涌入外城，增加了大量居宅，也增加了很多街巷，如：明时有很大空地的宣武门外，就增加了"西横街"、"中横街"、"东横街"等街巷，此外白纸坊等处，崇文门外等处亦是如此。
清朝政府的旗、汉分居政策促进了外城的发展，但由于新迁至外城的建筑已没有了老城街巷和胡同那样的统一规划，所以，新盖起来的房屋、院落就形成了大小不等、长短不一的不规范胡同。这些街道和胡同使北京城比明朝时期长大了一倍。