神武天皇就是秦朝时被秦始皇派遣寻找长生不老药的方士徐福，他和数千个童男女随从在到达日本之后一去不返，徐福更成为后来的神武天皇（日本现有的徐福墓是即附会此一说法而立），而现时的日本人（大和民族）亦被指是徐福和这群童男女的后裔。
秦始皇完成了他一统天下和建造长城的伟业，便开始憧憬长生不老的神奇。于是徐福在公元前219年来到秦王的宫廷，声称《山海经》上面记载的蓬莱、方丈、瀛洲三座仙岛就在东方海中，他愿意为秦王去那里取来不死之药。
第一次东渡，徐福并没有带回长生之药，他告诉始皇，东方的确有神药，但是神仙要三千童男童女、各种人间礼物。同时，海上航行有鲸鱼拦路，他要强弓劲弩射退大鱼。
秦始皇全盘答应条件，助他再次东渡。结果，徐福一去不复返，在东方“平原广泽之地”自立为王，再也不回来复命了。
传说中的仙岛，倒并不全是虚妄，仙没有，岛是有的。按照日本的记载，徐福所说的就是日本的本州、四国、九州三岛。日本的文字史料中，对徐福的记载含糊不清。但是按照部分日本史学界人士的观点，徐福，就是日本古代著名君主神武天皇。他登陆日本的地点，便在日本的关西平原。“神武东征”横扫日本的传说，就是基于徐福登陆日本、南征北战的事迹。
根据考古发现，分析古代墓葬遗骨证明，徐福东渡时期，日本关西近畿地区的居民平均身高骤然升高了5厘米，由此推断，这很可能是徐福和他的部属登陆后造成的局部人种改良。
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