法律分析：所谓综合工时，使企业因经营业务的特殊性，向当地劳动部门申请的忙时加班、闲时调休的一种弹性工时制度，虽然企业获得了综合工时的行政批准，但并不等于可以肆意安排加班和不顾员工休息时间的安排工作，综合工时制度仍然收到下列几条的限制：
1、每日加班不得超过3小时，每月不得超过36小时；
2、根据批复的综合工时制度周期，及时安排员工调休，不能安排调休的，仍然需要按照法定标准结算未能调休的加班费
3、国家法定假日是不能调休的，如企业安排员工在法定节假日工作，需要按照300%的加班费标准结算加班工资，实行计件工资的，按照平时计件定额的300%结算员工计件工资。
法律依据：《〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见的通知》规定：
六十二条：实行综合计算工时工作制的企业职工，工作日正好是周休息日的，属于正常工作；工作日正好是法定节假日时，要依照劳动法第四十四条第（三）项的规定支付职工的工资报酬。
六十五条：经批准实行综合计算工作时间的用人单位，分别以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
《中华人民共和国劳动法》：第四十四 有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。