捉摸不透和琢磨不透的不同如下：
1、意思不同
捉摸不透：猜测不清楚。
琢磨不透：揣摩不出来。
2、用法不同
捉摸不透：是没有凭据的猜测情况下使用。如：捉摸不透他的心思。
琢磨不透：是在有参考资料、有凭据的情况下进行推断。如：他刚刚说的话、做的事，我琢磨不透。
相关近义词
1、飘忽不定
指变幻无常，动荡不定。
2、捉摸不定
揣测不透；不肯定。出自明·施耐庵《水浒传》第二回：“却说朱武、杨春两个正在寨里猜疑，捉摸不定。”
3、犹豫不决
犹豫：迟疑。拿不定主意，下不了决心。出自《战国策·赵策三》：“平原君犹豫未有所决。”