吉林大学的王牌专业为：药理学与毒理学、免疫学、农业科学、动物学与植物学、数学、环境与生态学、材料加工工程、微电子学与固体电子学、计算机软件与理论、化学、材料科学、物理学、临床医学、生物学与生物化学、地球科学、工程学、分子生物学与遗传学、数量经济学、法学理论、刑法学等。
吉林大学重点学科专业
国家级特色专业建设点：法学、朝鲜语、新闻学、资源勘查工程、植物保护、临床医学、哲学、化学、车辆工程、放射医学、经济学、数学与应用数学、物理学、汉语言文学、机械工程及自动化、勘查技术与工程、制药工程（生物制药）
政治学与行政学、考古学、材料成型及控制工程、地下水科学与工程、财务管理、计算机科学与技术、测控技术与仪器、高分子材料与工程、地质学。
世界一流学科建设学科：考古学、数学、物理学、化学、材料科学与工程。一级学科国家重点学科：数学（覆盖基础数学、计算数学、概率论与数理统计、应用数学、运筹学与控制论二级学科）、化学（覆盖无机化学、分析化学、有机化学、物理化学
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