如果达到缴税标准应该扣个税，即扣除五险一金后超过5000的部分应该缴税。
应纳税所得额=工资收入金额－各项社会保险费－起征点(5000元)
应纳税额=应纳税所得额x税率－速算扣除数
据《中华人民共和国个人所得税法》有关规定，经国务院批准，现就生育津贴和生育医疗费有关个人所得税政策通知如下：
生育妇女按照县级以上人民政府根据国家有关规定制定的生育保险办法，取得的生育津贴、生育医疗费或其他属于生育保险性质的津贴、补贴，免征个人所得税。
生育津贴：生育当月缴费基数/30*产假天数
实际工作中，可以有如下两种操作办法：
（1）女职工产假期间先行发放产假期间工资（就是固定工资部分，不含奖金和与工作有关的补贴）；待生育津贴申领到帐后，进行对比：如果已发工资低于生育津贴，那么将差额部分一次性补发；如果已发工资高于生育津贴，那么不再补扣差额部分。
（2）先计算能够申领的生育津贴，从财务借款发放；等到申领完毕后社保支付生育贴冲抵借款。同时，应该将产假期间工资与生育津贴进行对比，补差发放。
注：以上两种方式，都是采取了先发放的方式，因为如果等到生育津贴申领下来才发放，女职工将有几个月领不到工资，这样做不合适，而且也会引起员工不满。
扩展资料：
一、个人所得税根据不同的征税项目，分别规定了三种不同的税率：
1、综合所得（工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得），适用7级超额累进税率，按月应纳税所得额计算征税。该税率按个人月工资、薪金应税所得额划分级距，最高一级为45%，最低一级为3%，共7级。
2、经营所得适用5级超额累进税率。适用按年计算、分月预缴税款的个体工商户的生产、经营所得和对企事业单位的承包经营、承租经营的全年应纳税所得额划分级距，最低一级为5%，最高一级为35%，共5级。
3、比例税率。对个人的利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得，偶然所得和其他所得，按次计算征收个人所得税，适用20%的比例税率。
二、征收管理
中国个人所得税的征收方式实行源泉扣缴与自行申报并用法，注重源泉扣缴。
个人所得税的征收方式可分为按月计征和按年计征。个体工商户的生产、经营所得，对企业事业单位的承包经营、承租经营所得，特定行业的工资、薪金所得，从中国境外取得的所得，实行按年计征应纳税额，其他所得应纳税额实行按月计征。
三、计算方法
应纳税所得额=月度收入-5000元（起征点）-专项扣除（三险一金等）-专项附加扣除-依法确定的其他扣除。
参考资料来源：