笔迹鉴定流程是：申请司法笔迹鉴定，提交《司法鉴定申请书》；申请人提交供与检材比对的样本；质证；法院通知当事人选鉴定机构；摇号；交鉴定费；现场提取检材、比对样本；鉴定机构依法出具《鉴定意见书》；对鉴定意见的质证，具体如下：
1、申请司法笔迹鉴定，提交《司法鉴定申请书》
根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第九十二条第一款 私文书证的真实性，由主张以私文书证证明案件事实的当事人承担举证责任。
2、申请人提交供与检材比对的样本
因借款人否认借条上的签名是其本人所写，现借条本身真伪不明，故需要申请人提交有借款人亲笔签名的其他相关材料作为样本与借条进行比对。
3、质证
法院应当组织当事人对鉴定材料进行质证。未经质证的材料，不得作为鉴定的根据。质证结束后，双方核对质证笔录无误后签字捺印。
4、法院通知当事人选鉴定机构
经质证确定比对样本后，就要选取鉴定机构了，尽管《民事诉讼法》第七十六条规定当事人可以就查明事实的专门性问题向人民法院申请鉴定。当事人申请鉴定的，由双方当事人协商确定具备资格的鉴定人；协商不成的，由人民法院指定。
5、摇号
双方当事人在规定时间到法院司法鉴定技术室或专门摇号室现场摇号选取鉴定机构。
6、交鉴定费
摇号确定鉴定机构后，司法鉴定技术室会出具《鉴定委托书》委托鉴定机构对申请人的申请事项进行鉴定。出借人申请笔迹鉴定的，出借人单独预交鉴定费；双方都申请笔迹鉴定的，双方各预交一半鉴定费，笔迹鉴定收费标准详见《司法鉴定收费办法》。
7、现场提取检材、比对样本
经摇号确定鉴定机构后，法院司法鉴定技术室会向双方当事人送达《提取鉴定样本通知》或电话通知。鉴于检材即借条原件往往由出借人持有，故出借人届时携带借条原件到法院供鉴定机构扫描提取即可。
8、鉴定机构依法出具《鉴定意见书》
鉴定机构提取检材、样本后，依据《文件鉴定通用规范GB∕T37234-2018》、《笔迹鉴定技术规范(GB∕T37239-2018)》 、《篡改(污损)文件鉴定技术规范(GB∕T37238-2018)》，30个工作日内出具《鉴定意见书》。
9、对鉴定意见的质证
法院收到鉴定书后，应当及时将副本送交当事人。当事人如果对鉴定书的内容有异议，应当在法院指定期间内以书面方式提出。法院收到书面异议后应当要求鉴定人作出解释、说明或者补充，认为有必要的，可以要求鉴定人对当事人未提出异议的内容进行解释、说明或者补充。
基础的送检材料审查完毕后，笔迹检验通常分以下三步走：分别检验、比较检验、综合评断。分别检验是指对检材和样本分别进行检验，确定其特征，然后构建特征体系，然后比较二则的特征体系，在二者特征体系的基础上判断相似性。