一般说，肝细胞受乙肝病毒入侵后，乙肝病毒本身并不直接引起肝细胞病变。乙肝病毒只是利用肝细胞摄取的养料赖以生存并在肝细胞内复制。病毒有很多种，但侵犯人体细胞有两种病变形式，一种是在细胞内分裂繁殖，最后将细胞破坏放出新衍生的病毒，如流行性感冒病毒。另一种是在细胞内复制，最后从细胞表面芽生出新的病毒，如乙型肝炎病毒。前者是直接破坏人体细胞，后者不直接破坏人的细胞，而是通过人体免疫系统攻击被病毒侵犯的肝细胞，使肝细胞破坏；免疫系统又通过人体产生的抗病毒的抗体中和了病毒使病毒消失。 如果感染了乙肝病毒的人免疫系统正常，就能及时产生抗体消灭病毒，对于破坏了的肝细胞可以通过自身修复达到康复。只有约1／10的人由于免疫功能不正常或先天有缺陷（或先天感染病毒，那时人的免疫系统还未发育正常），才不能及时消灭病毒而成为乙肝病毒长期携带者。
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