1．河流水质
2008年，我国对约15万公里的河流水质进行了监测评价，其中Ⅰ类水河长占评价河长的3.5%，Ⅱ类水河长占31.8%，Ⅲ类水河长占25.9%，Ⅳ类水河长占11.4%，Ⅴ类水河长占6.8%，劣Ⅴ类水河长占20.6%。全国全年Ⅰ～Ⅲ类水河长比例为61.2%，与2007年基本持平。各水资源一级区中，西南诸河区、西北诸河区、长江区、珠江区和东南诸河区水质较好，符合和优于Ⅲ类水的河长占95%～64%；海河区、黄河区、淮河区、辽河区和松花江区水质较差，符合和优于Ⅲ类水的河长占35%～47%。
2．湖泊水质
通过对44个湖泊的水质的监测评价表明，水质符合和优于Ⅲ类水的面积占44.2%，Ⅳ类和Ⅴ类水的面积共占32.5%，劣Ⅴ类水的面积占23.3%。对44个湖泊的营养状态进行评价，其中有1个湖泊为贫营养，中营养湖泊有22个，轻度富营养湖泊有10个，中度富营养湖泊有11个。国家重点治理的“三湖”情况如下：
太湖：若水质评价不包括总磷、总氮的核算，湖体水质均劣于Ⅲ类，Ⅳ类、Ⅴ类、劣Ⅴ类水面积分别占评价面积的7.4%、27.2%和65.4%。若总磷、总氮不参加水质评价，则Ⅱ类水面积占18.8%，Ⅲ类水面积占64.5%，IV类水面积占13.8%，劣Ⅴ类水面积占2.9%。东太湖和东部沿岸的湖水属于轻度富营养水质，其他地区都是中度富营养状态。
滇池：该水域的氮、磷和好样有机物的污染相当严重，无论总磷和总氮参加评价与否，Ⅴ类水面均占评价水面的28.3%，劣Ⅴ类水面占71.7%。全湖处于中度富营养状态。
巢湖：湖区西部要比东部的污染程度严重很多。若总磷、总氮不参加评价，东半湖评价水面水质为Ⅲ类，西半湖评价水面为Ⅳ类，总体水质为Ⅳ类。若总磷、总氮参加评价，东半湖评价水面水质为Ⅳ～Ⅴ类，西半湖为劣Ⅴ类，总体水质为劣Ⅴ类。东半湖处于中度富营养状态，西半湖处于中度富营养状态。
3．水库水质
我国对378座水库进行了监测评价，其中水质优于和符合Ⅲ类水即水质优良的水库有303座，占评价水库总数的80.2%；水质未达到Ⅲ类水的水库有75座，占评价水库总数的19.8%，其中水质为劣Ⅴ类水的水库有16座。对347座水库的营养状态进行评价，中度营养水库有241座，轻度富营养水库86座，中度富营养水库18座，重度富营养水库2座。
4．省界水体水质
对全国298个省界断面的水质进行了监测评价，水质符合和优于地表水Ⅲ类标准的断面数占总评价断面数的44.6%，水污染严重的劣Ⅴ类占27.5%。各水资源一级区中，省界断面水质较好的是西南诸河区和东南诸河区，淮河区、海河区、辽河区省界断面水质较差。省界断面的主要超标项目是化学需氧量、高锰酸盐指数、氨氮、五日生化需氧量和挥发酚等。
5．地下水水质
2008年，根据641眼监测井的水质监测资料，北京、辽宁、吉林、上海、江苏、海南、宁夏、广东8个省（自治区、直辖市）对地下水水质进行了分类评价。水质适合于各种使用用途的Ⅰ～Ⅱ类监测井占评价监测井总数的2.3%，适合集中式生活饮用水水源及工农业用水的Ⅲ类监测井占23.9%，适合除饮用外其他用途的Ⅳ～Ⅴ类监测井占73.8%。
6．水功能区水质达标状况
2008年全国监测评价水功能区3219个，按水功能区水质管理目标评价，全年水功能区达标率为42.9%，其中一级水功能区达标率为53.2%，二级水功能区达标率36.7%。在一级水功能中，保护区达标率为65.5%，保留区达标率为67.7%，缓冲区达标率为25.9%。