在人防工事中种菇，必须首先解决通风换气、人工照明、调节温度、湿度、防治杂菌、害虫等问题，才可望季季种菇，年年高产。
在人防工事种菇过程中，食用菌和工作人员均需吸收洞中的氧气放出二氧化碳。由于人防工事自然通风换气条件一般较差，规模生产时常需辅以机械通风，以维持洞内空气新鲜，才能获得成功。
解决通风问题有两个途径：
（1）择地段栽培，借助竖井和洞口解决通风问题
根据季节变化，选择自然通风较好的位置，如靠近洞口、竖井的通道、主干道作为种菇场所。此法经济简便，但可用面积有限。笔者曾用此法，在华中农业大学山北防空洞主干道中瓶栽香菇、畦栽平菇、蘑菇等食用菌，获得成功。
（2）机械通风
借助风机或通风管道，强制工事内外空气交换，把洞外的新鲜空气送入洞中，同时将洞内污浊空气排出洞外。机械通风有固定式全面通风和移动式局部通风两种类型。固定式全面通风不经济，且死角多，效果较差，不宜采用。移动式局部通风经济有效。适于人防工事采用的通风机可分为离心式和轴流式两种类型。离心式风机产生的风压高，风量小，送风距离远，适宜比较大的地道、坑道使用。轴流式风机送风量大，风压低，送风距离短，对小型地下室、地道比较适宜。
选择风机时还要根据人防工事大小、结构，栽培菇种类、面积等，选用风量合适的风机。一般面积在1000米2以下的人防工事，可选用风量为1000米3/小时的风机；面积大于1000米2的人防工事，可选用风量为1500～2000米3/小时的风机。
机械送风时，要向地面、四壁、空中灵活送风，消灭死角。因为通风是手段，换气是目的，送风适量即可。不要使风对着床面或子实体吹，防止过分失水萎蔫。
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