法律分析：申请减免个人所得税的流程：
(一)个人申请
符合规定享受减免税优惠的个人，应对照减免税政策和减免税项目，在发放个人工资薪金前，向财务处提交减免税申请及相关资料。
(二)资料提供
申请享受减免税优惠的个人，应提供的资料主要包括：
1.申请人本人签名的享受减免税优惠的申请原件2.本人有效证件(身份证、护照等)复印件3.与申请减免税项目直接相关的文件、证书、证件复印件，如批准为高层次人才的文件、证书，获省级人民政府、国务院部委和中国人民解放军军以上单位以及外国组织、国际组织颁发奖金的文件、证书，享受政府特殊津贴的专家、学者的文件、证书等4.其他相关资料,如本人应取得相应收入的证明、合同、协议等资料，与减免税项目相关的资料。
(三)报主管税务机关办理
财务处收到个人提交的减免个人所得税申请及相关资料后，经初步检查并汇总当月减免个人所得税的申请，拟订公司当月办理减免个人所得税申请并整理完善有关资料，经领导审批、加盖公章后报主管税务机关办理。
(四)主管税务机关核实
经主管税务机关核实，符合享受减免个人所得税优惠的，向公司出具未盖公章的税务事项通知书和纳税人减免税备案表，经公司法人签字、加盖公司公章后，送主管税务机关盖章。
(五)信息公开
主管税务机关出具的税务事项通知书和纳税人减免税备案表盖章，个人所得税减免税备案手续完成。财务处及时将税务事项通知书和纳税人减免税备案表在OA系统和财务处网站公开。
(六)报销领款
申请人在OA系统或财务处网站查看到减免税备案完成的通知后，可持报销所需的相关材料到财务处办理报销领款手续。
(七)税务申报
在申请人办理完报销领款手续的次月，财务处将在税务局的个人所得税纳税申报系统中，为个人进行该项减免税事项的纳税申报。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》 第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。