南京航空航天大学的专业有自动化专业、交通运输专业和飞行器设计与工程等专业，排名如下：
1、第一名自动化专业
该专业培养知识、能力、素质各方面全面发展，是国家重点专业，培养能在工业企业、科研院所等部门从事有关运动控制、过程控制、制造系统自动化、自动化仪表和设备、智能监控系统、物联网等方面的工程设计、技术开发、系统运行管理与维护的自动化工程科技人才。
可从事自动化类企业、电气类企业相关岗位，例如自动化工程、自动化设计、软件工程、电力电子技术、供电技术等，主要课程有《模拟电路基础》、《DCS与组态软件》、《自动控制基础》等，核心知识领域包括电路及电子学基础、自动化基础理论、计算机技术基础等。
2、第二名交通运输专业
该专业培养德、智、体等方面全面发展，是国家重点专业，培养具备较坚实的数学、管理学、计算机、必要的人文社科和经济管理基础知识以及机电、土木、系统工程等工程技术基础知识，掌握载运工具运用与保障技术、客货运输组织及调度等的基本理论、知识与技能。
能在交通运输领域从事载运工具技术使用与管理、运输组织、管理和调度等工作，能在教学、科研单位从事相关教学科研工作的宽口径应用型和复合型工程技术、管理专门人才，能在交通类事业单位从事交通运输组织、交通运输指挥或交通工程类企业从事交通工程设计等工作
3、第三名飞行器设计与工程专业
该专业培养具有良好的数学、力学基础和飞行器总体设计、气动设计、结构与强度分析、试验技术等专业知识，能够从事航空航天工程、适航等领域的设计、科研与技术管理等工作的高级工程技术人才，可从事航空航天类企业岗位，例如飞行器设计、飞行器装配等。
主要课程有《空气动力学》、《CAD/CAE软件应用》、《电工及工业电子学》、《飞机CAD技术》、《飞机部件空气动力学》等，核心知识领域包括结构力学、空气动力学、飞行器总体设计、飞行器结构设计等。