在FAST的科学目标中，确实“包括寻找地外文明”，“但是这并不是我们排在最前列的目标”。“排在我们最前列的目标是寻找脉冲星。”脉冲星是快速自转的中子星，它能够发射严格周期性脉冲信号。脉冲星的观测研究不仅具有重要的物理意义，而且具有重要应用价值，在时间尺度、深空自主导航等方面具有重要的应用前景。 为什么要找脉冲星？王启明说，脉冲星会不断地发出脉冲信号，而这种信号非常稳定。“找到以后就可以应用于深空探测、星际旅行，可以起到导航作用。”他举例称，“如果你要走到火星，或者走出太阳系，甚至走出银河系，根本无法用地球上的GPS去导航，但如果能知道宇宙中很多脉冲星的位置，就可以通过它来定位、导航。”他还指出，航天航空的精确定位也离不开射电望远镜。“如果我们发射飞船去火星，飞船在走的过程中隔一段时间就发一个脉冲信号回来，我们的中国‘天眼’就可以接收到这个信号，判断它的位置，是否在正确轨道上。”人类在地面建实验室，高温高压强磁场都是很难实现的，而脉冲星的实验条件非常极端，它“对人类认识极端条件下的一些物理现象也有非常重大的意义”。除了观测脉冲星，中国“天眼”的另一大科学目标是“巡视宇宙中的中性氢”。他指出，这可以“研究宇宙大尺度物理学，以探索宇宙起源和演化”。
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