公司名称和商标名称不是一回事，注册的时候不一致是可以的。
公司名称一般有四部分组成：行政区划+字号+行业特点+组织形式。商标是商品的生产者、经营者在其生产、制造、加工、拣选或者经销的商品上或者服务的提供者在其提供的服务上采用的，用于区别商品或服务来源的，由文字、图形、字母、数字、三维标志、声音、颜色组合，或上述要素的组合，具有显着特征的标志，是现代经济的产物。
服务商标仅区别不同的服务出处，企业名称则可以识别不同企业的经营，包括服务和商品。一个企业可以有多个服务或商品的商标，但企业名称一般只有一个。
服务商标只要不违反《商标法》所禁用的条款，不侵犯他人商标专用权，不经注册就可使用，只是没有专用权。企业名称则必须经国家指定的主管机关核准登记、注册，才能使用。
服务商标一经核准注册，在全国享有专用权。企业名称仅在规定的区域内享有专用权。
服务商标的表现形式是文字、图形及其组合，企业名称只能用文字表示。
各国规范企业名称的法律有很大差异，商标则是用《商标法》和《反不正当竞争法》予以规范。
商标可转让或许可他人使用，企业名称不得单独转让，也不允许他人使用。
注册商标是依照商标法规定进行注册，而企业名称则依照公司法、外商投资企业法、中外合资企业法、中外合作经营企业法、合伙企业法、个人独资企业法、企业名称登记管理规定等法律、行政法规进行登记。
在我国，对商标实行自愿注册与强制注册相结合的原则，其做法是除按规定某些特定商品必须使用注册商标以外，一般商品的商标采取自愿注册原则，即注册的享有专用权，未注册的仍可使用，但不享有专用权;而对企业名称，未经核准登记的名称不准使用，也就不享有名称权。
商标权是工业产权，只具有财产权的特征，不带有人身性，而企业名称权是一种兼有人身权和财产权特征的权利。所以，企业名称权一般不允许单独转让或者许可他人使用。
企业名称.即商号，或厂商名称，它是企业的称谓。企业作为一种社会组织，要与其它社会组织发生业务联系，为了方便交易和不致发生业务混淆，客观上要求各企业有各自的名称。实际生活中，商标与企业名称往往一同出现在产品上，或出现在产品的广告宣传中。