有限公司注销后，应当按照以下方式处理债务：首先，有限公司应当及时对外发布公告，宣布已经进入到破产程序。其次，在债权人接到公告后，应当在期限内向有限公司申报债权。最后，在对共益债务和破产费用清偿完毕的情况下，按照法定顺序和程序对债务进行清偿。具体的清偿的顺序为：
1、公司员工的工资、基本养老保险、失业补偿金等。需要注意的是，董事、监事等高管人员的工资，按照公司员工的平均工资计算；
2、应当缴纳的税款以及其他的社会保险费用；
3、其他普通债务。
《中华人民共和国企业破产法》
第四十三条，破产费用和共益债务由债务人财产随时清偿。 债务人财产不足以清偿所有破产费用和共益债务的，先行清偿破产费用。 债务人财产不足以清偿所有破产费用或者共益债务的，按照比例清偿。 债务人财产不足以清偿破产费用的，管理人应当提请人民法院终结破产程序。人民法院应当自收到请求之日起十五日内裁定终结破产程序，并予以公告。