对大气环境造成污染的有害气体主要有二氧化硫、氟化物、臭氧、氮化物、氯气、碳氢化合物以及粉尘、烟尘、烟雾、雾气等气体、固体和液体颗粒。这些污染物既能直接伤害果树，影响植物体的光合作用，破坏叶绿素，致使花、叶片和果实褐变和脱落，又在植物体内进行积累，人们食用后引起急、慢性中毒。
（1）二氧化硫 二氧化硫是我国大气污染的主要有害气体。其主要来源于燃烧的煤、石油，在大气中广泛存在。二氧化硫由果树叶片上的气孔侵入叶片组织，破坏叶绿素，造成组织脱水，在叶脉间出现黄色或褐色斑块，使叶片脱落。果树开花期对二氧化硫最为敏感，可使花期开放不整齐，花冠边缘出现枯斑，花药变色，干瘪，柱头萎缩，花朵提早脱落，坐果率降低。果实受害后则表现为龟裂，发育受阻，失去商品价值。另外，二氧化硫遇水可变为亚硫酸，若果树上喷过波尔多液，则会将其中的铜离子游离出来，从而造成药害。
在自然条件下二氧化硫极易被氧化形成酸雨，危害果树叶片，使叶脉间出现失绿现象，并逐渐变为棕色坏死枯斑。
（2）氟化物 氟化物主要包括氟化氢、氟化硅、氟化钙及氟气，在大气中的含量仅次于二氧化硫。对人体、动植物为害极大。氟化物主要来源于磷肥、冶金、玻璃、搪瓷、塑料、砖瓦等生产工厂，以及用煤为主要能源的工厂排放的废气。其中，氟化氢是氟化物中毒性最大的气体，比二氧化硫大20倍，当空气中有1×10-7毫升/升时，即可使植物受害。另外，氟化物的比重较小，随风传播很远的距离。
氟化物对植物的为害主要是通过气孔进入体内，但不伤害气孔周边的组织，而是溶入体液内，通过细胞间隙进入输导组织，并运输到叶片尖端和边缘，当积累到一定浓度时即可出现病症。氟化物还能抑制植物体内的葡萄糖酶、磷酸果糖酶等多种酶的活性。当酶的活性下降时，阻碍叶绿素的合成，造成植物组织失绿，影响光合作用。另外，氟化物还能导致植物钙素营养失调，会使细胞液外溢，造成植物生长点、嫩叶、顶端发生溃烂。氟化物对果树的影响主要表现为破坏果树的营养生长、授粉、受精，降低坐果率，严重抑制秋梢生长，使叶片狭小，失绿，并造成早期落叶，果实不能正常膨大，果皮硬化等病症。
（3）氮化物 氮化物是各种含氮氧化物衍生物的总称。主要包括二氧化氮、一氧化氮、硝酸雾等，其中对植物毒害较大的是二氧化氮。其主要来源于汽车尾气、锅炉以及某些药厂排放的气体。另外，在保护地栽培条件下，当氮肥施用过多，土壤中会发生脱氮反应，从而使大棚中产生高浓度的二氧化氮，造成对植物的直接伤害。二氧化氮对植物毒害症状近似二氧化硫，但为害程度明显低于二氧化硫。
（4）氯气 氯气是一种黄色有毒气体，对果树为害极大。污染源主要是来自食盐电解工业以及生产农药、漂白粉、消毒剂、塑料、合成纤维等工厂排放的废气。氯气的危害比二氧化硫重，它可以破坏细胞结构，阻碍水分和养分的吸收，使植株矮化，分枝减少；叶片褪绿或起小水泡，严重时焦枯；根系不发达，直到根系萎蔫而枯死。
（5）粉尘和飘尘 空气中飘浮的固体或液体的微细颗粒被称为粉尘。工矿企业以煤炭为主要能源所排放的烟尘，是我国污染农作物及果林最重要的空气粉尘。烟尘的主要成分包括未燃尽的炭黑颗粒、煤粒和飞尘。烟尘中的颗粒粒径大于10微米，易降落，故叫降尘。这些烟尘降落到果树的叶片上，特别是嫩叶上会产生污斑，影响果树正常的光合、蒸腾和呼吸代谢等生理作用。在花期影响授粉和坐果；结果期污染，除果面形成污斑外，还会使果实表皮粗糙、木栓化，影响产量和品质，严重时果品失去商品价值。
另外，有的工厂还会向大气中排放出大量的极细小的金属微粒，如铅、镉、铬、锌、砷、汞、镍、锰等，这些微粒能较长时间在大气中飘浮，故称“飘尘”。飘尘因其体积微小，可随气流传播飘移至远处。飘尘在空气中因相互碰撞而吸附成为较大的粒子，降落地面后造成对土壤、灌溉水、果树的严重污染。如某炼锌厂周围0.5千米的农田，经该厂废气中排出镉尘污染6个月以后，每千克土壤含镉量由原来的0.7毫克上升到6.2毫克，增加了近9倍。
（6）其他污染 机动车排放的废气，工厂排放的二氧化硫、氧化氮和碳氢化合物，在特殊气候条件下发生化学反应，形成臭氧和过氧化硝酸乙酸酯，亦会对果树等造成污染。化工厂、化肥厂排放出的氨气和尿素粉尘，由于含氮量过高，可使果树营养元素比例失调，容易诱发生理落果。
大气的严重污染还会促进害虫的繁衍。国内外研究表明，大气污染除对作物造成危害以外，还会促进某些害虫种群的繁衍，表现为刺激害虫取食，促进害虫生长发育，提高害虫的生殖力，同时还会导致植物防御能力下降，改变植物体内的生理过程，杀伤天敌，破坏害虫和天敌的自然平衡。例如墨西哥瓢虫、舞毒蛾、蔷薇长管蚜、粉纹夜蛾，特别喜欢取食被二氧化硫、臭氧、氟化氢、汽车尾气污染的寄主植物；粉纹夜蛾幼虫取食被氟化氢污染的寄主植物后，发育明显加快，5龄幼虫体重增加24%；桃蚜取食被二氧化硫污染的寄主植物后，种群指数提高39.2%～91%；高速公路周边山楂树上苹果蚜的生殖力增强6倍等。由于瓢虫、寄生蜂、食蚜蝇等天敌受到不同程度的杀伤，促进了蚜虫的繁衍。