主要区别有，性质不同、作用不同、组成不同，具体如下：
一、性质不同
1、链条油
指用于各种链条的润滑油。
2、齿轮油
主要指变速器和后桥的润滑油。
二、作用不同
1、链条油
对链条起到润滑、防锈、防水、抗摩擦作用，可以提高传动效率和延长链条寿命。
2、齿轮油
主要起润滑齿轮和轴承、防止磨损和锈蚀、帮助齿轮散热等作用。以防止齿面磨损、擦伤、烧结等，延长其使用寿命。
三、组成不同
1、链条油
链条油由基础油和添加剂组成，根据基础油的不同可以分为：
①、矿物油链条油，基础油是矿物油，主要用于普通工况下。
②、合成油链条油，由合成油基础油组成，主要用于高温等工作环境下。
③、生物基链条油，主要由可再生的植物油基础油组成。
2、齿轮油
齿轮油以石油润滑油基础油或合成润滑油为主，加入极压抗磨剂和油性剂调制而成。
参考资料来源：百度百科-链条油
参考资料来源：百度百科-齿轮油
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