灵活就业社保和职工社保的区别有四个。
灵活就业人员社保是为切实保障灵活就业人员这一特殊劳动群体的社会保障权益，国家针对不同类别的灵活就业人员推出不同的社保优惠政策。
申请社会保险补贴的灵活就业人员，本人要持证明灵活就业状态相关凭证到户籍所在地街道（乡镇）劳动保障服务中心进行灵活就业认定，填写《灵活就业情况登记表》，经街道（乡镇）劳动保障服务中心认定后予以就业登记，并在《就失业证》中记录从事灵活就业有关情况。
职工社保具体指的是基本工伤保险、失业保险、养老保险、基本医疗保险、生育保险。法律规定，国家建立社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
灵活就业社保和职工社保区别共有四个。具体如下：
1、缴费可选险种不同
在职员工由单位和个人共同缴费，可以交城镇职工养老保险、城镇职工医疗保险（含生育保险）、城镇职工失业保险、城镇职工工伤保险。
灵活就业人员只能交城镇职工养老保险、城镇职工医疗保险，不能交生育保险、工伤保险，极少数省市可以交失业保险。
2、缴费比例不同
（1）城镇职工养老保险，在职职工缴费比例8%，灵活就业缴费比例20%，同样缴费基数4000元，一个只需要交320元，全部进入个人账户，另一个交800元，其中320元进入个人账户，剩下480元进入统筹账户；
（2）城镇职工医疗保险；在职人员缴费比例2%，灵活就业缴费比例不同省市有不同，一般5.6%-11%，缴费基数4000元，在职人员月扣80元；灵活就业人员月扣4000×9%=360元
3、生育待遇不同
（1）在职人员有生育保险，可以由生育津贴，可以领几个月上年度平均工资，可以休产假，假定休6个月，每个月津贴4000元，可以领取生育津贴24000元，不上班还有工资，而且生孩子产检和分娩费用，可以报销80%-95%。
（2）灵活就业人员，不能交生育保险，肯定没有生育津贴。少数省份灵活就业医保可以报销产检和分娩费用，绝大多数省份是没有生育费用报销的。如果灵活就业人员丈夫交了生育保险，丈夫可以申请一次性生育补助，有2000左右。
4、退休待遇成本不同。如果在职人员和灵活就业人员，选择的相同缴费基数，缴费年限和退休年龄相同，理论上退休待遇完全一样，但是两者付出的成本完全不同。上面已经说过，在职人员只需要交8%，灵活就业人员交20%。
就业方式不同，缴纳社保的方式就会有一定的差异。具体缴纳方式如下：
1、员工缴纳社保的流程
首先要进行社保登记，携带营业执照、组织机构代码证（办理营业执照时已在质量技术监督局办好）、法人身份证号码、税务登记证单位开户处拿一式三份的表格填写，核实完毕会拿到劳动和社会保障证，再去拿到社保证，如果要办理医保，到医保中心取表格。进行了社保登记就可以办理社保了。
（1）整理单位要办理社保人员的名单及身份证原件、复印件;
（2）新办人员需劳动合同原件及复印件;
（3）续保人员，确保个人窗口已报停、或前单位已报停;
（4）填写表格
在职职工社保异动表
职工信息登记表
公司开户登记表
（5）公司营业执照、代码证、法人身份证的原件及复印件、公章、职工名册、工资表、到单位所属区域社保局开户。
2、灵活就业社保缴纳流程
（1）个人可以以自由职业者的身份来缴纳社会保险，这里的社会保险包含两个方面的内容，分别是养老保险和医疗保险。参保的条件就是个人拥有城镇户口或者是农转非的户口，只要满足了这两个条件，就可以在当地的社会保障部门来缴纳个人养老保险和医疗保险；
（2）如果想要缴纳社保的话，需要到当地社区街道的社保服务点，或者是区县一级的社保局劳动保障局来办理相关的业务；
（3）在社保局或者市劳动保障局缴纳社会保险时，需要提供的基本资料，包括个人的户口本，身份证，身份证复印件，一寸照片若干等；
（4）个人的缴费标准是以上一年本地社保平均工资为基础的，其中养老保险的缴费比例是20%，医疗保险的缴费比例为9%。