首先，在工作原理上不同：微波炉： 微波炉主要是利用电磁波来对食物进行加热，在通电之后，电能变成微波传递到食物中，主要通过食物内分子的剧烈震动来达到加热的效果。微波炉加热食品与烤箱相反，是一个从内到外的过程，相比起烤箱而言加热速度也更快。
电烤箱：烤，顾名思义利用热管加热到设定温度后对实物进行持续加热。 电烤箱的加热管几乎都是暴露式的设计，它主要是利用加热管的热辐射来对食物进行加热，这是一种较为传统的加热方式，通过炉内的高温，热量由食物的外部向内部传递，主要通过热能来给食物加热。
在一般家庭的概念中，微波炉主要可以用来加热饭菜，同时兼具的其它功能也众多，而烤箱的功能虽然相对单一，只有会做烘焙的家庭才会较多的选择，但实际上，烤箱通过不同的温度和加热时间的组合，可以做出数百种美食，相比而言，烤箱是制造食物，微波炉才是加热实物。而电蒸箱，兼具制作食物和加热实物的两种功能。三者加热出的食物口感有所差别，使用范围也有一定程度的重叠。
由于烤箱的加热方式相对于传统，所以在加热过程中能够更好的保留食物原本的水分与口感，由外到内的加热方式能够让食物做到外酥里嫩，加热均匀通透，能够更好的迎合人们日常的饮食。因为加热速度没微波炉快，食物可以在烘焙过程中发生组织结构上的变化，比如面包和蛋糕制作过程。
微波炉由于使用电磁波加热，所以食物从内到外同时加热，所以加热速度也很快，随着食物分子的高速震动同时也会带来水分和营养的迅速流失，所以一般在微波炉中迅速翻热出来的食品水分较少，口感偏干偏硬，能够迅速，却较难兼顾到美味。更多家庭是把微波炉作为加热熟食来使用。当然，现在多功能的微波炉也加入了很多食谱功能，但食谱数量十分有限，远不及烤箱可以制作的食物多。
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