注意事项
在进行实时PCR实验时,需注意以下几点:首先,提RNA所用的枪头、器皿等耗材通常为商家处理好的成品,但在特殊情况下,实验者需用DEPC处理这些耗材。此外,市面上存在RNA酶清除试剂,能有效减少RNA降解。然而,清洗RNA沉淀所用的酒精需用DEPC处理后的水配制。其次,RT-PCR检测引物长度应控制在100bp-200bp之间,以保证扩增效率与操作简便性。为避免非特异性结合,推荐使用含基因组DNA去除成分的反转录试剂。同时,提取RNA应尽量在超净台内进行,以防止RNA污染。设置阴性对照,即使用双蒸水代替cDNA模板,有助于防止非特异性扩增。加样的准确性对实验结果影响较大,为避免误差,应混合好体系后再分装,最后添加DNA。孔板或8连管上机前离心,可去除孔壁液滴,充分混合溶液。
常见问题
在进行实时PCR实验时,会遇到样品间差异大的问题。可能原因是基因含量低,30循环以上含量较低,导致孔间差异大。解决方法是尝试减小反转录产物的稀释倍数。此外,加样不均匀,特别是加DNA模板时,可能导致枪头中的样品打不干净。建议将相同的成分预先混合均匀后再加样。另外,对于新引物,初次使用时,建议设置阴性对照,以检查引物的特异性。
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