法律分析：1、确诊患者的医疗费用，有医保的，经医保报销后，个人负担的部分由财政给予补助；没有医保的由财政补贴。2、疑似患者的医疗费用，处理方式同上；3、患者在异地就医的费用，医保部分由就医地医保部门先行垫付，个人部分由就医地财政部门负责支付，中央财政予以补助；所以，治疗费用是政府来兜底的。
法律依据：《中华人民共和国传染病防治法》 第四十二条 传染病暴发、流行时，县级以上地方人民政府应当立即组织力量，按照预防、控制预案进行防治，切断传染病的传播途径，必要时，报经上一级人民政府决定，可以采取下列紧急措施并予以公告：
（一）限制或者停止集市、影剧院演出或者其他人群聚集的活动；
（二）停工、停业、停课；
（三）封闭或者封存被传染病病原体污染的公共饮用水源、食品以及相关物品；
（四）控制或者扑杀染疫野生动物、家畜家禽；
（五）封闭可能造成传染病扩散的场所。上级人民政府接到下级人民政府关于采取前款所列紧急措施的报告时，应当即时作出决定。紧急措施的解除，由原决定机关决定并宣布。