甲鱼有生炒、清蒸、红烧、煲汤等多种烹调方法，其中做汤是最有营养的一种做法，用它做好的甲鱼汤具有特别好的滋补功效，能补中益气，缓解体虚，而且能温补肾阳，还能提高人类身体的抗衰老能力，它能让人体吸收甲鱼中的大部分营养。
生炒甲鱼
生炒甲鱼在做的时候需要准备一只甲鱼，把它放在80度的开水中冲烫一下，去掉表皮，然后放在清水中浸泡，去掉血水以后，再用料酒和胡椒粉腌制，把它剁成块状，在锅中放适量食用油加热后，放入葱姜蒜炒出香味，随后把切好的甲鱼肉锅快速翻炒，炒到甲鱼变色以后，放适量料酒和清水用大火烧开，再用小火炖煮10分钟，放适量食用盐和香葱末，再用生淀粉勾芡，做好以后能直接出锅。
清蒸甲鱼
清蒸甲鱼也是甲鱼最常见的烹调方法，在做的时候需要把甲鱼放在开水中烫一分钟烫到它表面的外膜褪掉，再用剪刀把他的脚趾甲全部剪掉，随后从他的微布剪开翻开盖子，这时要把他体内的脂肪仔细的清理掉，冲洗干净以后，加适量食用盐和料酒，以及大蒜和大料，还有枸杞子，姜丝等调味料调匀腌制10分钟，腌好以后的甲鱼入蒸锅隔水蒸，开锅后蒸15分钟，蒸到它熟透以后，去掉蒜瓣和大料，淋上热油就能吃。
红烧甲鱼
红烧甲鱼在做的时候不但要准备一只甲鱼，还要准备适量五花肉和生抽，老抽，冰糖等多种调味料，在做的时候需要把甲鱼提前处理干净切成块，在炒锅中放适量食用油加热后把姜入锅煎到变色，随后放入切好的五花肉和甲鱼块，煎出油脂，放入生抽老抽和冰糖加水煮开，继续用中小火炖煮20分钟，随后放适量食用盐调味，最后把汤汁收浓，这是色泽红润的红烧甲鱼就能做好。
甲鱼做汤最有营养
平时用甲鱼做甲鱼汤就有营养，能让人们品尝到它的鲜嫩滋味，而且能让人体尽可能多的吸收甲鱼中的丰富营养，在做的时候需要把甲鱼提前宰杀处理干净，然后放在汤锅中加入适量红枣，枸杞，桂圆，再放入葱姜花椒大料等调味料，加入足量清水加热煮开，再用中小火炖煮两小时，炖好以后加食用盐调味，出锅以后吃肉喝汤就能让人体吸收甲鱼中的营养，也能让它发挥好的食用功效。
民间有“鲤鱼吃肉，王八喝汤”的说法，意思是吃鲤鱼目的在食其肉，而吃甲鱼（俗名“王八”）目的则在于喝汤，因为甲鱼营养全面，最适宜于做汤喝，这样更能起到大补的作用，所以甲鱼的一般吃法是做汤。
甲鱼滋腻，久食败胃伤中，导致消化不良，故食欲不振、消化功能减退、孕妇或产后虚寒、脾胃虚弱腹泻之人忌食；患有慢性肠炎、慢性痢疾、慢性腹泻便溏之人忌食；肝炎患者久食会加重肝脏负担，严重时值诱发肝昏迷，故应少食；另外痰食壅盛者慎食。