地铁燕房线和房山线分开的原因有：线路设计不同、运营单位不同。
1、线路设计不同：燕房线和房山线的设计规格和标准不同，燕房线采用的是地铁标准，而房山线采用的是市域（郊）铁路标准。这意味着两列列车的尺寸、运行速度和载客量等都有所不同，因此需要分别独立运行。
2、运营单位不同：燕房线和房山线的运营单位也不同，燕房线由北京地铁集团运营，而房山线由北京市域铁路公司运营。这意味着两条线路的票务系统和运营管理模式也不同，需要分开独立运行。
燕房线的价值意义
北京地铁燕房线连接了房山新城两大核心组团燕房组团和良乡组团，也是一条房山新城与中心城区连接线路。线路有效改善了房山新城的交通环境，对于加速房山新城的发展具有重要的意义。开通后将有效改善了房山新城的交通环境，对于加速房山新城的发展具有重要的意义。
北京地铁燕房线支线出饶乐府站后继续沿京周路西行，跨越石房铁路并逐渐转入京周路路中，在城关中心区南部设老城区站。之后线路继续在京周路路中西行，于马刨泉以南设顾册站。而后线路继续在京周路路中西行，最终于京周路路中、房易路以东设支线终点周口店站。
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