其实，玉米棒子不是一个整体，每一个玉米粒都是一个单独的个体，它们的基因型不同，导致每一颗玉米的颜色都有可能不同。当然如果父本母本都是纯和黄色的，就没有什么可以说的了，但是如果是杂合的，就有可能出现这种“花”的玉米棒子。 导致这些玉米展现出色彩的，的确是色素，不过是玉米自己产生的罢了，让人一粒一粒染，还不得死人啊…… 以紫色为例，玉米的紫色色素合成是一个复杂的过程，前体需要在三种酶的作用下依次形成无色、红色与紫色的色素。这样，如果用拥有/缺乏这三个酶的亲本进行一次杂交的话，后代的分离就会导致无色、红色、和紫色三种种子——前提是如果其他色素都不能合成的话。 而实际上玉米可以合成的色素远不止这一种（不然我们吃的黄玉米哪里来的），所以多种色素混合形成各种奇葩的色彩完全是无压力的。
彩色玉米并不是转基因技术生产的。 玉米棒上的每一粒玉米都是一个独立的花粉受精，它们的基因型也就不同，导致每一颗玉米的颜色都有可能不同。各种纯色的玉米种在一块儿地里，相互授粉就会出现彩色玉米了。当然前提是纯色玉米也是非转基因的。我们通常说的玉米籽粒颜色主要是糊粉层颜色； 就像我们人类有黑人、白人、黄种人等，玉米糊粉层颜色有黄、白、紫等，用不同颜色的玉米杂交就会在后代中产生同时包含多种颜色的彩色玉米； 目前常见的“彩色玉米”多为甜玉米或者糯玉米； 目前没有科学的相关研究证实食用转基因食品对人体有害； 转基因和非转基因不能通过外观进行区分开的。
彩色玉米（Zea mays var）是作为一项新兴的种植业，近年来正在我国大江南北悄然兴起。由于彩色玉米营养成分比普通玉米高，加之种植方法简单，又宜于鲜食和加工，经济效益一直是普通玉米的几倍甚至十几倍，因此，彩色玉米的种植与加工，被专家誉为中国未来具有广阔开发利用前景的农业项目之一。彩色玉米成熟采集后可置于室内观赏。在彩色玉米成熟后，可以采集到室内观赏，如果再加上太阳暴晒或者加热爆裂就可以食用了。
彩色玉米的品种：1．印度红玫瑰爆裂玉米。该品种采用系统杂交方法选育而成。株高160厘米，穗长15厘米左右，籽粒红色，光彩鲜丽，穗型整齐美观，品质一流，爆花率极高，亩产300公斤。 2．巴西五彩玉米。该品种又叫“变色玉米”，是从巴西单穗引进系统选育而成的新型粘玉米。最大特点是自然分色，种时种籽为黑红色，待青玉米成熟后即变成黑、白、黄等颜色相间美丽多彩的玉米，让人既惊奇又喜爱，食用香粘可口，风味独特，抢早栽培85天左右即可上市，效益十分可观。 3．泰国花仙子玉米。该品种是从泰国引入的集色、香、味、营养于一身的新型特种玉米。全生育期105天，鲜食85天，玉米颜色红黄相间，整齐有序，既有艺术观赏、又有食用价值，俗称“八里香”（指在远的地方就能闻到烤食玉米的芳香味），市场堪称一绝，既可鲜食，又可速冻保鲜和加工，推广价值极大。
